Additional file 1 of Selection on the promoter regions plays an important role in complex traits during duck domestication
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1. Table S1. Summary of multi-omics sequencing data during duck domestication. Table S2. Variation annotation detected in mallard and Pekin duck populations. Table S3. Genes that are located in the top 5% of selected regions. Table S4. The effect and number of variations in the gene body of selected genes in the mallard and Pekin duck population. Table S5. Selection and regulation characteristics of upstream selected genes. Table S6. Summary of ATAC-Seq data mapped to the mallard reference genome. Table S7. Summary of Hi-C data mapped to the mallard reference genome. Table S8. Genes located near the differential TAD boundaries between mallard and Pekin duck. Table S9. Different expression signatures of genes with selected promoters with potential regulatory regions in upstream of breast muscle, liver, and fat tissues. Table S10. The traits affected by genes with selected promoters with functions related to selected traits in other studies. Table S11. Quantitative Results of Medium and Long Chain Fatty Acids by Gas Mass Spectrometry. Table S12. Specific differentially expressed genes during adipocyte differentiation induced by overexpression of ELOVL3 compared with wild type. Table S13. Sequence information relating to primers designed in this study. Table S14. Standard curve of Medium and Long Chain Fatty Acids by Gas Mass Spectrometry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,072 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».