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Enregistrement W4394412082 · doi:10.6084/m9.figshare.24892832

Additional file 1 of Selection on the promoter regions plays an important role in complex traits during duck domestication

2023· dataset· en· W4394412082 sur OpenAlexaff
Zhongtao Yin, Xiaoqin Li, Yun-Xiao Sun, Jacqueline Smith, Maxwell T. Hincke, Ning Yang, Zhuocheng Hou

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDomesticationBiologySelection (genetic algorithm)GeneticsEvolutionary biologyComputational biologyComputer scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1. Table S1. Summary of multi-omics sequencing data during duck domestication. Table S2. Variation annotation detected in mallard and Pekin duck populations. Table S3. Genes that are located in the top 5% of selected regions. Table S4. The effect and number of variations in the gene body of selected genes in the mallard and Pekin duck population. Table S5. Selection and regulation characteristics of upstream selected genes. Table S6. Summary of ATAC-Seq data mapped to the mallard reference genome. Table S7. Summary of Hi-C data mapped to the mallard reference genome. Table S8. Genes located near the differential TAD boundaries between mallard and Pekin duck. Table S9. Different expression signatures of genes with selected promoters with potential regulatory regions in upstream of breast muscle, liver, and fat tissues. Table S10. The traits affected by genes with selected promoters with functions related to selected traits in other studies. Table S11. Quantitative Results of Medium and Long Chain Fatty Acids by Gas Mass Spectrometry. Table S12. Specific differentially expressed genes during adipocyte differentiation induced by overexpression of ELOVL3 compared with wild type. Table S13. Sequence information relating to primers designed in this study. Table S14. Standard curve of Medium and Long Chain Fatty Acids by Gas Mass Spectrometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0720,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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