Additional file 1 of Population transcriptomic analysis identifies the comprehensive lncRNAs landscape of spike in wheat (Triticum aestivum L.)
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Table S1. Summary of all lncRNAs. Table S2. Summary of all lncRNA-mRNA pairs. Table S3. GO and KEGG enrichment of all target mRNAs. Table S4. Homologous lncRNAs between wheat and other species. Table S5. Sequence conservation of wheat lncRNAs based on results of whole-genome alignment. Table S6. Message of samples in population analysis. Table S7. Nucleotide diversity in each group. Table S8. Detail information of haplotype in lncRNA or target mRNA. (Yellow annotation indicates that gene has different haplotypes in different populations). Table S9. Interrelationship of ceRNA network between lncRNA, miRNA and mRNA. Table S10. Overlap between lncRNA or target mRNA and GWAS signals. Table S11. Overlap between lncRNA or target mRNA and known QTLs. Table S12. Overlap between lncRNA or target mRNA and introgression regions. Table S13. Information of 93 wheat lines. Table S14. Primers used for qRT-PCR analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,844 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».