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Enregistrement W4394438268 · doi:10.6084/m9.figshare.9872915

Blocking Notch signal pathway suppresses the activation of neurotoxic A1 astrocytes after spinal cord injury

2019· dataset· en· W4394438268 sur OpenAlexaff
Dingfei Qian, Linwei Li, Yuluo Rong, Wei Liu, Qian Wang, Zheng Zhou, Changjiang Gu, Yifan Huang, Xuan Zhao, Jian Chen, Jin Fan, Guoyong Yin

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2019
Typedataset
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlocking (statistics)Spinal cordSpinal cord injuryNeuroscienceSignal pathwayNotch signaling pathwaySignal transductionChemistryBiologyCell biologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spinal cord injury (SCI) is a catastrophic disease which has complicated pathogenesis including inflammation, oxidative stress and glial scar formation. Astrocytes are the most abundant cells in central nervous system and fulfill homeostatic functions. Recent studies have described a new reactive phenotype of astrocytes, A1, induced by inflammation, which may have negative effects in SCI. As the Notch signaling pathway has been linked to cell differentiation and inflammation, we aimed to investigate its potential role in the differentiation of astrocytes in SCI. Contusive SCI rat model showed elevated A1 astrocyte numbers at the damage site 28 days after SCI and the expression levels of Notch signaling and its downstream genes were upregulated parallelly. Western blotting, RT-qPCR and immunofluorescence revealed that blocking of Notch pathway using γ-secretase blocker (DAPT) suppressed the differentiation of A1 astrocytes. Flow cytometry, and TUNEL staining indicated that DAPT alleviated neuronal apoptosis and axonal damage caused by A1 astrocytes likely through the Notch-dependent release of pro-inflammatory factors. CO-IP and western blotting revealed an interaction between Notch pathway and signal transducer and activator of transcription 3 (Stat3), which played a vital role in differentiation of A1 astrocytes. We conclude that phenotypic transition of A1 astrocytes and their neurotoxity were controlled by the Notch-Stat3 axis and that Notch pathway in astrocytes may serve as a promising therapeutic target for SCI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,130

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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