Additional file 2 of Association between polygenic risk for Alzheimer’s disease and brain structure in children and adults
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2: Table S1. Descriptive details about study sample. Table S2. Number of SNPs at each p-value inclusion threshold. Table S3. A comprehensive list of all MRI metrics examined in our study. Table S4. Interaction of PRS-hemisphere for regional cortex (CA, CT, CV). Table S5. Interaction of PRS-hemisphere for white matter tracts (FA, MD). Table S6. Interaction of PRS-hemisphere for subcortical volume (SV). Table S7.Results for association between all eight PRS and regional cortex (CA, CT, CV). Table S8. Results for association between all eight PRS and subcortical volume (SV). Table S9. Results for association between all eight PRS and whitematter tracts (FA, MD). Table S10. Sensitivity analysis results (ABCD -(Kunkle et al. 2019)) for association between all eight PRS and regional cortex (CA, CT, CV). Table S11. Sensitivity analysis results (ABCD -(Kunkle et al. 2019)) for association between all eight PRS and subcortical volume(SV). Table S12. Sensitivity analysis results (ABCD - (Kunkle et al.2019)) for association between all eight PRS and white matter tracts (FA, MD). Table S13. Results for association between all eight PRS (excluding APOE along with adjust APOE genotype) and regional cortex(CA, CT, CV). Table S14. Results for association between all eight PRS (excluding APOE along with adjust APOE genotype) and subcortical volume (SV). Table S15. Results for association between all eight PRS (excluding APOE along with adjust APOE genotype) and whitematter tracts (FA, MD). Table S16. Sensitivity analysis results (UKB -adjust 40PCs) for association between all eight PRS and regional cortex (CA, CT, CV). Table S17. Sensitivity analysis results (UKB - adjust 40PCs) for association between all eight PRS and subcortical volume (SV). Table S18.Sensitivity analysis results (UKB - adjust 40PCs) for association between all eight PRS and white matter tracts (FA, MD). Table S19. Sensitivity analysis results (ABCD - adjust birth weight and gestational age) for association between all eight PRS and regional cortex (CA, CT, CV). Table S20. Sensitivity analysis results (ABCD - adjust birth weight andgestational age) for association between all eight PRS and subcortical volume(SV). Table S21. Sensitivity analysis results (ABCD - adjust birthweight and gestational age) for association between all eight PRS and whitematter tracts (FA, MD). Table S22. Sensitivity analysis results (outliers winsorized) for association between all eight PRS and regional cortex (CA, CT, CV). Table S23. Sensitivity analysis results (outliers winsorized) for association between all eight PRS and subcortical volume (SV). TableS24. Sensitivity analysis results (outliers winsorized) for association between all eight PRS and white matter tracts (FA, MD).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,034 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,833 | 0,099 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».