Genetic diversity and population genetic structure in <i>Kadsura coccinea</i> (Schisandraceae), an evergreen woody vine from Hunan, China
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Notice bibliographique
Résumé
Kadsura coccinea is an evergreen woody vine species indigenous to Southeast Asia and south China with great promise in medicine, food, and ornamental gardening. Its natural resources have decreased dramatically due to irrational fruits and roots harvesting in two decades recently, which may result in heavy erosion of its genetic resources, especially in Hunan Province, China. Here 406 individuals of K. coccinea were collected from 11 natural populations in Hunan Province, and were analyzed for genetic variation using 17 polymorphic microsatellite markers. A total of 163 alleles were amplified with a mean of 9.588 alleles per locus. The mean effective number of alleles per locus, allele richness and the expected heterozygosity of these populations were 2.910, 4.171 and 0.558 on average, respectively, indicating a bit low level of genetic diversity. The among-population differentiation (F<sub>ST</sub>) accounted for 13.63% of the total genetic variation, and analysis of molecular variance also showed 13.38% of genetic variation existed among populations, representing a high genetic differentiation and a bit limited gene flow (N<sub>m</sub> = 1.813) among these populations. The results of Bayesian clustering analysis and neighbor-joining clustering analysis showed that populations GD and YZ were specific, and CB and HT were assigned into a cluster. The mantel test demonstrated that the genetic distances revealed by pairwise F<sub>ST</sub> between populations were remarkably correlated to geographic distances. It is the first report on genetic diversity of species in genus Kadsura using molecular markers, and the findings provide fundamental base for genetic resources conservation and breeding of this species.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle