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Enregistrement W4394487267 · doi:10.6084/m9.figshare.23550416

Additional file 1 of CircNFATC3 promotes the proliferation of gastric cancer through binding to IGF2BP3 and restricting its ubiquitination to enhance CCND1 mRNA stability

2023· dataset· en· W4394487267 sur OpenAlexaff
Feifei Yang, Qiang Ma, Bo Huang, Xiaolin Wang, Xiaojuan Pan, Ting Yu, Lingyu Ran, Shan Jiang, Haiping Li, Ye Chen, Yuying Liu, Ce Liang, Junwu Ren, Yuying Zhang, Shimin Wang, Wei Li, Bin Xiao

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUbiquitinCancer researchCyclin D1Messenger RNACancerChemistryCell biologyBiologyInternal medicineMedicineBiochemistryGeneCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1: Table S1. Characteristics of GC patients for circNFATC3 measurement. Table S2. Probes for RNA-FISH. Table S3. Primers for amplification of indicated circRNAs and genes. Table S4. Characteristics of GC patients for TMA. Table S5. Probes targeting circNFATC3 for TMA. Table S6. SiRNAs sequences. Table S7. Probes for RNA pull-down. Table S8. CircRNAs interacting with IGF2BP3 in SGC7901 cells (Top 50). Table S9. Upregulated genes in STAD of the TCGA database (Log2(Fold Change)>2). Table S10. mRNAs interacting with IGF2BP3 in SGC7901 cells evaluated by RIP-seq. Table S11. Downregulated genes evaluated by RNA-seq in SGC7901 cells following IGF2BP3 knockdown.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,358
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3580,078

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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