RNA-seq reveals that multiple plant hormones are regulated by <i>Bacillus cereus</i> G2 in <i>Glycyrrhiza uralensis</i> subjected to salt stress
Notice bibliographique
Résumé
Bacillus cereus G2 can alleviate the adverse effect caused by salt in Glycyrrhiza uralensis Fisch. Transcriptome in the salt (S) treatment and control (CK) groups with or without G2 (CK + B or S + B) were sequenced to identify G2 regulate genes and response pathways under salt stress in G. uralensis. A total of 3608 differentially expressed genes (DEGs) were identified, of which 1589, 623, 469, and 927 DEGs were identified in S vs CK, CK + B vs CK, S + B vs S and S + B vs CK + B comparisons, respectively. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis revealed that G2 improved salt-tolerance mainly by regulating phytohormone in G. uralensis. Specifically, G2 up-regulated the DEGs related to auxin (IAA) signal transduction, abscisic acid (ABA) biosynthesis, signal transduction, and catabolism, and jasmonic acid (JA) biosynthesis and signal transduction under salt stress. Overall, multiple phytohormones were involved in the interaction of salt stress and G2 in G. uralensis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».