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Enregistrement W4394492205 · doi:10.6084/m9.figshare.17104787

RNA-seq reveals that multiple plant hormones are regulated by <i>Bacillus cereus</i> G2 in <i>Glycyrrhiza uralensis</i> subjected to salt stress

2021· dataset· en· W4394492205 sur OpenAlexaff
Xiang Xiao, Qiuli Wang, Duoyong Lang, Yuankui Chu, Yu Zhang, Li Zhou, Xinhui Zhang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typedataset
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacological Effects of Natural Compounds
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycyrrhiza uralensisBacillus cereusRNA-SeqBiologyTranscriptomeBotanyGeneGeneticsGene expressionBacteriaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<i>Bacillus cereus</i> G2 can alleviate the adverse effect caused by salt in <i>Glycyrrhiza uralensis</i> Fisch. Transcriptome in the salt (S) treatment and control (CK) groups with or without G2 (CK + B or S + B) were sequenced to identify G2 regulate genes and response pathways under salt stress in <i>G. uralensis</i>. A total of 3608 differentially expressed genes (DEGs) were identified, of which 1589, 623, 469, and 927 DEGs were identified in S vs CK, CK + B vs CK, S + B vs S and S + B vs CK + B comparisons, respectively. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis revealed that G2 improved salt-tolerance mainly by regulating phytohormone in <i>G. uralensis</i>. Specifically, G2 up-regulated the DEGs related to auxin (IAA) signal transduction, abscisic acid (ABA) biosynthesis, signal transduction, and catabolism, and jasmonic acid (JA) biosynthesis and signal transduction under salt stress. Overall, multiple phytohormones were involved in the interaction of salt stress and G2 in <i>G. uralensis</i>.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0820,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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