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Enregistrement W4394521378 · doi:10.6084/m9.figshare.15134664.v2

Orientin mediates protection against MRSA-induced pneumonia by inhibiting Sortase A

2021· dataset· en· W4394521378 sur OpenAlexaff
Li Wang, Shisong Jing, Han Qu, Kai Wang, Yajing Jin, Ying Ding, Lin Yang, Hangqian Yu, Yan Shi, Qianxue Li, Dacheng Wang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrientinPneumoniaSortase ASortaseMicrobiologyVitexinStaphylococcus aureusMedicineChemistryBiologyInternal medicineBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drug-resistant pathogenic <i>Staphylococcus aureus</i> (<i>S. aureus</i>) has severely threatened human health and arouses widespread concern. Sortase A (SrtA) is an essential virulence factor of <i>S. aureus</i>, which is responsible for the covalent anchoring of a variety of virulence-related proteins to the cell wall. SrtA has always been regarded as an ideal pharmacological target against <i>S. aureus</i> infections. In this research, we have determined that orientin, a natural compound isolated from various medicinal plants, can effectively inhibit the activity of SrtA with an IC<sub>50</sub> of 50.44 ± 0.51 µM. We further demonstrated that orientin inhibited the binding of <i>S. aureus</i> to fibrinogen and diminished biofilm formation and the attaching of Staphylococcal protein A (SpA) to the cell wall <i>in vitro</i>. Using the fluorescence quenching assay, we demonstrated a direct interaction between orientin and SrtA. Further mechanistic studies revealed that the residues Glu-105, Thr-93, and Cys-184 were the key sites for the binding of SrtA to orientin. Importantly, we demonstrated that treatment with orientin attenuated <i>S. aureus</i> virulence of <i>in vivo</i> and protected mice against <i>S. aureus</i>-induced lethal pneumonia. These findings indicate that orientin is a potential drug to counter <i>S. aureus</i> infections and limit the development of drug resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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