Datasets and R codes: An empirical test of the relative and combined effects of land-cover and climate change on local colonization and extinction
Notice bibliographique
Résumé
This fileset includes the R code and associated data used in Yalcin & Leroux (in review). Yalcin S., Leroux S.J. (in review). An empirical test of the relative and combined effects of land-cover and climate change on local colonization and extinction. Thanks to all data providers:Ontario Breeding Bird Atlas (Bird Studies Canada, Canadian Wildlife Service, Federation of Ontario Naturalists, Ontario Field Ornithologists, and Ontario Ministry of Natural Resources) for supplying Atlas data, and to the thousands of volunteer participants who gathered data for the project, and Cadman et al. (1987; 2007);Natural Resource Canada and McKenney et al. (2011) for supplying climate data;Global Forest Watch Canada and Lee (2007) for publicly sharing datasets of anthropogenic changes;Food and Agriculture Organization of the United Nations and Bai et al. (2008) for publicly sharing data of net primary productivity changes. The raw datasets can be found: Ontario Breeding Bird Atlas:Website: http://www.birdsontario.org/atlas/index.jspCadman M. D., Eagles, P. F. J., Helleiner, F. M. (Eds.) (1987) Atlas of Breeding Birds of Ontario 1980-1985. Waterloo, Canada: University of Waterloo Press.Cadman M. D., Sutherland, D. A., Beck G. G., Lepage D., Couturier, A. R. (Eds.) (2007) Atlas of Breeding Birds of Ontario 2001-2005. Toronto, Canada: Bird Studies Canada, Environment Canada, Ontario Field Ornithologists, Ontario Ministry of Natural Resources, Ontario Nature.Climate data: McKenney, D. W., Hutchinson, M. F., Papadopol, P. et al., (2011) Customized spatial climate models for North America. Bulletin of the American Meteorological Society, 92, 1611-1622. Global Forest Watch Canada:Website: http://www.globalforestwatch.ca/data/20101210ALee P. (2007) Recent Anthropogenic Changes within the Boreal Forests of Ontario and Their Potential Impacts on Woodland Caribou (A Global Forest Watch Canada Report). Edmonton, Canada: Global Forest Watch Canada.Changes in net primary productivity:Bai Z., Dent D., Olsson L., Schaepman M. (2008) Proxy global assessment of land degradation. Soil Use and Management, 24, 223–234.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,024 | 0,171 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,109 | 0,070 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».