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Enregistrement W4394539161 · doi:10.6084/m9.figshare.19213884

Assessment of deoxynivalenol and deoxynivalenol derivatives in <i>Fusarium graminearum</i>-inoculated Canadian maize inbreds

2022· dataset· en· W4394539161 sur OpenAlexaffabout
Barbara A. Blackwell, Danielle Schneiderman, Indira Thapa, Whynn Bosnich, Kyle Pimentel, Aida Z. Kebede, L. M. Reid, Linda J. Harris

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusariumMycotoxinInoculationBiologyVomitoxinAgronomyZearalenoneBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The prevalence of maize, wheat and other cereal crops in Ontario, Canada, has led to frequent epidemics of ear rot and head blight disease caused by the broad host pathogen Fusarium graminearum. This fungus produces the trichothecene deoxynivalenol (DON) which is one of the most common mycotoxins contaminating food and feed globally and poses a risk to human and animal health. DON is commonly glycosylated by plant hosts into deoxynivalenol-3-glucoside (DON-3G) as part of a defence mechanism to detoxify and sequester mycotoxins. However, it has been documented that DON-3G can be hydrolyzed in the digestive system of animals, increasing the bioavailability of DON. There is a need for additional documentation of the incidence and ratio of DON-3G to DON in Canadian cereal crops. We investigated the occurrence and relative proportion of DON and modified DON compounds in Canadian-adapted maize germplasm with a wide range of ear rot tolerance. Forty-nine maize inbreds were manually challenged (kernel inoculation) with F. graminearum (15-ADON chemotype) as well as phenotyped for tolerance to Gibberella ear rot (GER) under field conditions. LC/MS was used to analyse 581 maize samples for DON, DON-3G, 15-ADON, and 15-ADON-3G. The DON-3G to DON mean molar ratio ranged from 3.1 to 19.7%. DON content was positively correlated with GER disease severity (r = 0.66, p < 0.01), while the DON-3G:DON molar ratio and disease severity were negatively correlated (r = −0.64, p < 0.001). Thus, GER-tolerant maize genotypes had relatively lower total DON content and higher DON-3G:DON ratios.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,819
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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