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Enregistrement W4394557097 · doi:10.6084/m9.figshare.22621784

Additional file 1 of Belowground microbiota analysis indicates that Fusarium spp. exacerbate grapevine trunk disease

2023· dataset· en· W4394557097 sur OpenAlexaff
Yonghua Li, Xinghong Li, Wei Zhang, Jiao Zhang, Hui Wang, Junbo Peng, Xuncheng Wang, Jiye Yan

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensBruyèreCentre for Advancing Health OutcomesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusariumBiologyTrunkDiseaseBotanyHorticultureMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1: Table S1. The environmental temperature conditions during the seasons of 2019 and 2020. Table S2. The physical and chemical characteristics of the soil in the sampling vineyard. Table S3. The records of chemical agents and fertilizers in the sampling vineyard. Table S4. The reads numbers used to analyze in this study. Table S5. Alpha diversity index values for fungal communities in different soil–plant compartments. PE: rhizoPlane and Endophyte; R: rhizosphere; and B: bulk soils. Samples were collected from grapevine trunk disease (GTD) asymptomatic (As) and symptomatic (S) grapevines in 2019 (0.19) and 2020 (0.20). Table S6. Operational taxonomic units (OTUs) specific to asymptomatic or symptomatic samples. Table S7. The relative abundances of grapevine trunk disease (GTD)-associated fungi annotated at the species and genus levels detected with ITS amplicon sequencing data. Table S8. Grapevine trunk disease (GTD)-associated fungi exhibiting significant differences in relative abundance between comparison groups based on ITS amplicon sequencing. Statistical differences were evaluated with Wilcoxon tests. Table S9. Disease index values for grapevines inoculated with isolates in this study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,858

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3980,081

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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