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Enregistrement W4394561073 · doi:10.6084/m9.figshare.16780399

FLT4/VEGFR3 activates AMPK to coordinate glycometabolic reprogramming with autophagy and inflammasome activation for bacterial elimination

2022· dataset· en· W4394561073 sur OpenAlexaff
Li Ma, Weiyun Li, Yanbo Zhang, Linlin Qi, Qi Zhao, Na Li, Yao Lu, Luqing Zhang, Fei Zhou, Yichun Wu, Yongning He, Hongxiu Yu, Yulong He, Bin Wei, Hongyan Wang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammasomeReprogrammingAutophagyCell biologyAMPKChemistryBiologyImmunologyInflammationCellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages rapidly undergo glycolytic reprogramming in response to macroautophagy/autophagy, inflammasome activation and pyroptosis for the clearance of bacteria. Identification the key molecules involved in these three events will provide critical potential therapeutic applications. Upon <i>S. typhimurium</i> infection, FLT4/VEGFR3 and its ligand VEGFC were inducibly expressed in macrophages, and FLT4 signaling inhibited CASP1 (caspase 1)-dependent inflammasome activation and pyroptosis but enhanced MAP1LC3/LC3 activation for elimination of the bacteria. Consistently, FLT4 mutants lacking the extracellular ligand-binding domain increased production of the proinflammatory metabolites such as succinate and lactate, and reduced antimicrobial metabolites including citrate and NAD(P)H in macrophages and liver upon infection. Mechanistically, FLT4 recruited AMP-activated protein kinase (AMPK) and phosphorylated Y247 and Y441/442 in the PRKAA/alpha subunit for AMPK activation. The AMPK agonist AICAR could rescue glycolytic reprogramming and inflammasome activation in macrophages expressing the mutant FLT4, which has potential translational application in patients carrying <i>Flt4</i> mutations to prevent recurrent infections. Collectively, we have elucidated that the FLT4-AMPK module in macrophages coordinates glycolytic reprogramming, autophagy, inflammasome activation and pyroptosis to eliminate invading bacteria. <b>Abbreviations:</b> 3-MA: 3-methyladenine; AICAR: 5-aminoimidazole-4-carboxamide1-β-D-ribofuranoside; AMP: adenosine monophosphate; AMPK: AMP-activated protein kinase; ATP: adenosine triphosphate; BMDM: bone marrow-derived macrophage; CASP1: caspase 1; CFUs: colony-forming units; FLT4/VEGFR3: FMS-like tyrosine kinase 4; GFP: green fluorescent protein; LDH: lactate dehydrogenase; LPS: lipopolysaccharide; MAP1LC3/LC3: microtubule-associated protein 1 light chain 3; PEM: peritoneal exudate macrophage; PRKAA1/AMPKα1: protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit; PYCARD/ASC: PYD and CARD domain containing; ROS: reactive oxygen species; SQSTM1/p62: sequestosome 1; TLR4: toll-like receptor 4; ULK1: unc-51 like autophagy activating kinase 1; VEGFC: vascular endothelial growth factor C; WT: wild type

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1520,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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