In silico design and evaluation of multi-epitope dengue virus vaccines: a promising approach to combat global dengue burden
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Dengue virus, a pervasive mosquito-borne pathogen, imposes a substantial global health burden and is responsible for numerous fatalities annually globally, with tropical and sub-tropical regions particularly susceptible to dengue outbreaks. Despite decades of efforts, there has been no effective treatment or prevention for dengue, which makes it a life-threatening disease. Hence, this study proposes an innovative bioinformatics-driven approach to construct a vaccine targeting the dengue virus. The study involved a comprehensive analysis of conserved regions of dengue virus serotypes 1–4's non-structural proteins (NS1, NS3, and NS5) and structural protein (E) to predict the potential B & T-cell epitopes which were linked with appropriate adjuvants and linkers to generate four distinct vaccine candidates. The constructed vaccine models underwent rigorous evaluation, considering physicochemical attributes, structural integrity, population coverage, and immune system response through simulation. The results confirm that these vaccine candidates are non-allergenic, non-toxic, antigenic, and immunogenic. Additionally, they exhibit 99.70% world population coverage and 100% conservation across all dengue strains, which is crucial for vaccine efficacy. A Ramachandran plot showed that 95.6% of the amino acid residues of the candidates belong to the optimal zone, while around 4% are in additional allowed regions. Further, molecular docking and dynamic simulation of interaction with the human toll-like receptor 4, a fundamental component of innate immunity, was carried out to gain more insight into interaction dynamics. As a result of these analyses, the candidates' binding dynamics and structural stability were revealed. Overall, this study presents promising vaccine candidates for addressing dengue's global health burden. Their robust design and demonstrated immunogenicity make them attractive candidates for further experimental testing and development as potential vaccines against current strains and future variants.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».