Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs with BWA-MEM
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Résumé
Summary: BWA-MEM is a new alignment algorithm for aligning sequence reads or long query sequences against a large reference genome such as human. It automatically chooses between local and end-to-end alignments, supports paired-end reads and performs chimeric alignment. The algorithm is robust to sequencing errors and applicable to a wide range of sequence lengths from 70bp to a few megabases. For mapping 100bp sequences, BWA-MEM shows better performance than several state-of-art read aligners to date. Availability and implementation: BWA-MEM is implemented as a component of BWA, which is available at http://github.com/lh3/bwa. Contact: hengli@broadinstitute.org
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
La notice
- Revue
- DROPS (Schloss Dagstuhl – Leibniz Center for Informatics)
- Thématique
- Cell Image Analysis Techniques
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- —
- Organismes subventionnaires
- National Human Genome Research InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaDirectorate for Biological SciencesIsrael Institute for Biological ResearchJapan Society for the Promotion of ScienceCentre for Biotechnology and BioengineeringNational Institutes of HealthNational Science Foundation
- Mots-clés
- ContigSequence (biology)clone (Java method)Sequence assemblyComputational biologyGeneticsBiologyComputer scienceGenomeDNAGene
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui