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Enregistrement W4394687825 · doi:10.1002/sam.11679

Data‐driven stochastic model for quantifying the interplay between amyloid‐beta and calcium levels in Alzheimer's disease

2024· article· en· W4394687825 sur OpenAlexafffund
Hina Shaheen, Roderick Melnik, Sundeep Singh

Notice bibliographique

RevueStatistical Analysis and Data Mining The ASA Data Science Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward IslandWilfrid Laurier UniversityUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesJanssen Alzheimer Immunotherapy Research And DevelopmentJohnson and Johnson Pharmaceutical Research and DevelopmentNational Institute on AgingAgencia Estatal de InvestigaciónNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthEisai CanadaH. Lundbeck A/SServierEisaiShared Hierarchical Academic Research Computing NetworkMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesNorthern California Institute for Research and EducationIXICOTakeda Pharmaceutical CompanyAlzheimer's AssociationFujirebio USDoD Alzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheRocheAbbVie CanadaUniversity of Southern CaliforniaNovartis Pharmaceuticals CorporationChesapeake Research ConsortiumU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyAlliance de recherche numérique du CanadaBristol-Myers SquibbAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerckGE HealthcareBasque Center for Applied MathematicsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale Diagnostics
Mots-clésDiseaseBETA (programming language)Amyloid (mycology)Amyloid betaAlzheimer's diseaseNeuroscienceComputer scienceBiologyMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The abnormal aggregation of extracellular amyloid‐β in senile plaques resulting in calcium dyshomeostasis is one of the primary symptoms of Alzheimer's disease (AD). Significant research efforts have been devoted in the past to better understand the underlying molecular mechanisms driving deposition and dysregulation. Importantly, synaptic impairments, neuronal loss, and cognitive failure in AD patients are all related to the buildup of intraneuronal accumulation. Moreover, increasing evidence show a feed‐forward loop between and levels, that is, disrupts neuronal levels, which in turn affects the formation of . To better understand this interaction, we report a novel stochastic model where we analyze the positive feedback loop between and using ADNI data. A good therapeutic treatment plan for AD requires precise predictions. Stochastic models offer an appropriate framework for modeling AD since AD studies are observational in nature and involve regular patient visits. The etiology of AD may be described as a multi‐state disease process using the approximate Bayesian computation method. So, utilizing ADNI data from ‐year visits for AD patients, we employ this method to investigate the interplay between and levels at various disease development phases. Incorporating the ADNI data in our physics‐based Bayesian model, we discovered that a sufficiently large disruption in either metabolism or intracellular homeostasis causes the relative growth rate in both and , which corresponds to the development of AD. The imbalance of ions causes disorders by directly or indirectly affecting a variety of cellular and subcellular processes, and the altered homeostasis may worsen the abnormalities of ion transportation and deposition. This suggests that altering the balance or the balance between and by chelating them may be able to reduce disorders associated with AD and open up new research possibilities for AD therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,303
Tête enseignante GPT0,488
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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