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Enregistrement W4394692766 · doi:10.1038/s42003-024-06106-8

State-dependent binding of cholesterol and an anionic lipid to the muscle-type Torpedo nicotinic acetylcholine receptor

2024· article· en· W4394692766 sur OpenAlexafffund
Anna Ananchenko, Rui Yan Gao, François Dehez, John E. Baenziger

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreEuropean Regional Development FundCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCentre National de la Recherche ScientifiqueNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésPhosphatidic acidTorpedoChemistryNicotinic acetylcholine receptorAcetylcholine receptorPhospholipidBiophysicsPhosphatidylcholineNicotinic agonistLipid bilayerBiochemistryCholesterolReceptorBiologyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of the Torpedo nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) to undergo agonist-induced conformational transitions requires the presence of cholesterol and/or anionic lipids. Here we use recently solved structures along with multiscale molecular dynamics simulations to examine lipid binding to the nAChR in bilayers that have defined effects on nAChR function. We examine how phosphatidic acid and cholesterol, lipids that support conformational transitions, individually compete for binding with phosphatidylcholine, a lipid that does not. We also examine how the two lipids work synergistically to stabilize an agonist-responsive nAChR. We identify rapidly exchanging lipid binding sites, including both phospholipid sites with a high affinity for phosphatidic acid and promiscuous cholesterol binding sites in the grooves between adjacent transmembrane α-helices. A high affinity cholesterol site is confirmed in the inner leaflet framed by a key tryptophan residue on the MX α-helix. Our data provide insight into the dynamic nature of lipid-nAChR interactions and set the stage for a detailed understanding of the mechanisms by which lipids facilitate nAChR function at the neuromuscular junction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,578
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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