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Enregistrement W4394729046 · doi:10.1093/mtomcs/mfae015

ESI–MS analysis of Cu(I) binding to apo and Zn7 human metallothionein 1A, 2, and 3 identifies the formation of a similar series of metallated species with no individual isoform optimization for Cu(I)

2024· article· en· W4394729046 sur OpenAlexaff
Adyn Melenbacher, Martin J. Stillman

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetallothioneinChemistryGene isoformElectrospray ionizationMetalMetalloproteinStoichiometryMass spectrometryBiochemistryZincPhysical chemistryOrganic chemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metallothioneins (MTs) are cysteine-rich proteins involved in metal homeostasis, heavy metal detoxification, and protection against oxidative stress. Whether the four mammalian MT isoforms exhibit different metal binding properties is not clear. In this paper, the Cu(I) binding properties of the apo MT1A, apo MT2, and apo MT3 are compared and the relative Cu(I) binding affinities are reported. In all three isoforms, Cu4, Cu6, and Cu10 species form cooperatively, and MT1A and MT2 also form a Cu13 species. The Cu(I) binding properties of Zn7-MT1A, Zn7-MT2, and Zn7-MT3 are compared systematically using isotopically pure 63Cu(I) and 68Zn(II). The species formed in each MT isoform were detected through electrospray ionization-mass spectrometry and further characterized using room temperature phosphorescence spectroscopy. The mixed metal Cu, Zn species forming in MT1A, MT2, and MT3 have similar stoichiometries and their emission spectral properties indicate that analogous clusters form in the three isoforms. Three parallel metallation pathways have been proposed through analysis of the detailed Cu, Zn speciation in MT1A, MT2, and MT3. Pathway ① results in Cu5Zn5-MT and Cu9Zn3-MT. Pathway ② involves Cu6Zn4-MT and Cu10Zn2-MT. Pathway ③ includes Cu8Zn4-MT. Speciation analysis indicates that Pathway ② is the preferred pathway for MT2. This is also evident in the phosphorescence spectra with the 750 nm emission from Cu6Zn4-MT being most prominent in MT2. We see no evidence for different MT isoforms being optimized or exhibiting preferences for certain metals. We discuss the probable stoichiometry for MTs in vivo based on the in vitro determined binding constants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil0,626

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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