Bioinformatics-Guided Discovery of miRNAs Involved in Apoptosis Modulated by Parthenolide Combined with Vincristine in The NALM6 Cell Line.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: , parthenolide, is a potential anticancer agent that can modulate the expression of miRNAs and induce apoptosis. The objective of this study was to investigate the effect of parthenolide in combination with vincristine and alone on the apoptosis rate and expression of miR-125b-5p, miR-181b-5p, and miR-17-5p in the NALM6 cell line. MATERIALS AND METHODS: In this experimental study, cell viability and metabolic activity were determined through MTT assay and PI staining. Flow cytometry was applied to evaluate the rate of apoptosis. The expression of miRNAs was assessed using real-time polymerase chain reaction. Bioinformatic analyses, including Cytoscape, RNAhybrid, and signaling pathway analysis were employed to investigate the association of miR-17-5p, miR-181b-5p and miR-125b- 5p with apoptosis. Further, molecular docking served to validate the modulation of these miRNAs by parthenolide and vincristine treatment. RESULTS: The MTT assay indicated that 7.7 μM of parthenolide decreased the metabolic activity to 50% after 48 hours. PI staining analysis indicated that at concentrations below the half maximal inhibitory concentration, parthenolide caused 50% cell death. Flow cytometric analysis indicated that parthenolide (1.925 μM) in combination with vincristine (1.2 nM) induced apoptosis in 83.2% of the cells. Real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRTPCR) analysis showed significant changes in the expression levels of miR-17-5p, miR-125b-5p, and miR-181b-5p. Moreover, the combination therapy downregulated the expression of miRNAs significantly. This was consistent with our bioinformatic analysis demonstrating that the studied miRNAs are regulators of apoptosis. Finally, molecular docking validated the modulation of the miRNAs by parthenolide and vincristine. CONCLUSION: Parthenolide in combination with vincristine triggers apoptosis at a high rate in the NALM6 cell line. Moreover, this combination therapy can decrease the expression of miR-17-5p, miR-181b-5p, and miR-125b-5p.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».