MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4394742008 · doi:10.1101/2024.04.09.588593

High-Dimensional Imaging of Vestibular Schwannoma Reveals Distinctive Immunological Networks Across Histomorphic Niches in <i>NF2</i> -related Schwannomatosis

2024· preprint· en· W4394742008 sur OpenAlexaff
Adam P. Jones, Michael Haley, Grace E. Gregory, Cathal John Hannan, Ana K. Simmons, Leoma Bere, Daniel G. Lewis, Pedro Oliveira, Miriam J. Smith, Andrew T. King, D. Gareth Evans, Pawel Paszek, David Brough, Omar Pathmanaban, Kevin N. Couper

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilManchester Biomedical Research CentreMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of ManchesterCancer Research UK
Mots-clésBiologyMyeloidMerlin (protein)SchwannomaCancer researchImmunotherapySchwann cellT cellPathologyMass cytometryPhenotypeGeneImmunologyMedicineCell biologyImmune systemSuppressorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract NF2 -related Schwannomatosis ( NF2 SWN) is a rare tumour-predisposition syndrome characterised by the growth of multiple central and peripheral nervous system neoplasms. The drivers of NF2 SWN are pathogenic variants in the tumour suppressor gene NF2 , encoding the protein Merlin, leading to development of bilateral vestibular schwannoma (VS) in >95% of patients. VS tumours are characterised by infiltration of myeloid cells and lymphocytes, highlighting the potential of immunotherapy for VS. However, the immunological landscape in VS and the spatial determinants within the tumour microenvironment that shape the trajectory of disease are presently unknown. In this study, to elucidate the complex immunological networks across VS, we performed imaging mass cytometry (IMC) on clinically annotated VS samples from NF2 SWN patients. We reveal the heterogeneity in neoplastic cell, myeloid cell and T cell populations that co-exist within VS, determining that the cellular composition of VS tumours is independent of NF2 -SWN genetic severity. We show that distinct myeloid cell and Schwann cell populations exist within varied spatial contextures across characteristic Antoni A and B histomorphic niches. Interestingly, we show that T-cell populations associate with tumour-associated macrophages (TAMs) in Antoni A regions, seemingly limiting their ability to interact with tumorigenic Schwann cells. This spatial landscape is altered in Antoni B regions, where T-cell populations appear to interact with PD-L1+ Schwann cells. We also demonstrate that prior bevacizumab treatment (VEGF-A antagonist) preferentially reduces alternatively-activated TAMs, whilst enhancing CD44 expression, in bevacizumab-treated tumours. Together, we describe niche-dependent modes of T-cell regulation in NF2 SWN VS, indicating the potential for microenvironment-altering therapies for VS. Teaser Imaging mass cytometry and spatial omic analyses illustrate spatially-distinct regions of T-cell regulation in vestibular schwannoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetNeurofibromatosis and Schwannoma CasesTravaux en français237 207