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Enregistrement W4394768998 · doi:10.1101/2024.04.11.24305670

CSF proteomic analysis of semorinemab Ph2 trials in prodromal-to-mild (Tauriel) and mild-to-moderate (Lauriet) Alzheimer’s disease identifies distinct trial cell-type specific proteomic signatures

2024· preprint· en· W4394768998 sur OpenAlexaff
Alyaa M. Abdel‐Haleem, Ellen Casavant, Balázs István Tóth, Edmond Teng, Cecília Monteiro, Nikhil J Pandya, Casper C. Hoogenraad, Brad A. Friedman, Felix L. Yeh, Veronica G. Anania, Gloriia Novikova

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensRoche (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseClinical trialMedicineBiologyComputational biologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Targeting of tau pathology has long been proposed as a potential therapeutic strategy for Alzheimer’s disease (AD). Semorinemab is a humanized IgG4 monoclonal antibody that binds to all known isoforms of full-length tau with high affinity and specificity. Semorinemab’s safety and efficacy have been studied in two Phase 2 randomized, double-blind, placebo-controlled, parallel-group clinical trials: Tauriel (prodromal-to-mild AD; NCT03289143 ) and Lauriet (mild-to-moderate AD; NCT03828747 ). CSF was collected from a subset of patients at baseline and after 49 or 73 weeks in Tauriel and baseline and after 49 or 61 weeks in Lauriet. We generated a large proteomics dataset, using more than 250 cerebrospinal fluid (CSF) samples and detecting more than 3500 proteins, to investigate the effects of semorinemab in each trial. Treatment-induced proteomic signatures were defined for each study as a set of proteins significantly elevated in the treatment arm in the respective study. Integration of the corresponding gene signatures with two independent brain single-nucleus RNA-seq datasets from AD and healthy aged controls revealed that Lauriet signature genes were enriched in microglial cells, while Tauriel signature genes were more broadly expressed across major brain cell types. Furthermore, the Lauriet trial gene signature was significantly upregulated in microglia from AD patients as compared to non-demented controls. The elevation of proteins such as CHI3L1 and GPNMB with treatment suggested an activated glial state. Taken together, this study utilizes a large CSF clinical proteomics dataset to assess the pharmacodynamic response of semorinemab and contributes to our understanding of how an anti-tau antibody influences disease-relevant pathophysiology in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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