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Enregistrement W4394850723 · doi:10.1101/2024.04.15.589510

Subcellular, biochemical and biophysical alterations in two glial cell models of ARSACS

2024· preprint· en· W4394850723 sur OpenAlexaboutno aff
Fernanda Murtinheira, Ana Sofia Boasinha, João Belo, Luana Macedo, Elisa Farsetti, Tiago T. Robalo, Vukosava Milic Torres, Francisco Pinto, Adelaide Fernandes, Patrícia Georgina Garcia do Nascimento, Mário S. Rodrigues, Federico Herrera

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação para a Ciência e a TecnologiaResearch Executive AgencyUniversidade de LisboaEuropean Commission
Mots-clésCellChemistryNeuroscienceBrain CellCell biologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) is a developmental and degenerative disorder caused by loss-of-function mutations in the gene that codifies for the sacsin chaperone. Sacsin was initially described as a neuronal protein but is found in various cell types, including astroglial, microglial, kidney, and skin cell lines. We and others have shown that virtually all cell and animal models of ARSACS show disruption of intermediate filament (IF) cytoskeleton and organelle distribution. This article extends previous observations from our lab on the C6 astroglial-like model and describes the development and characterization of a new human microglial cell model based on HMC3 cells. HMC3 cells knocked out for sacsin show similar alterations to C6 astroglial-like cells: aberrant distribution of IF network and organelles, downregulation of developmental transcription factors STAT3 and Smad1, and alterations in autophagy machinery and markers of intracellular stress, resulting in morphological changes. Our results extend previous observations suggesting a possible role for glial cells in ARSACS and provide new tools to understand the glial-specific mechanisms involved in this pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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