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Enregistrement W4394856585 · doi:10.1371/journal.pone.0302126

Transcriptome analyses in juvenile yellow perch (Perca flavescens) exposed in vivo to clothianidin and chlorantraniliprole: Possible sampling bias

2024· article· en· W4394856585 sur OpenAlexafffundabout
Maeva Giraudo, Laurie Mercier, Andrée D. Gendron, Jim Sherry, Magali Houde

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect and Pesticide Research
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesEnvironment and Climate Change Canada
Mots-clésPerchClothianidinBiologyPopulationJuvenileZoologyPesticideEcologyFisheryFish <Actinopterygii>MedicineThiamethoxam

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The St. Lawrence River is an important North American waterway that is subject to anthropogenic pressures including intensive urbanization, and agricultural development. Pesticides are widely used for agricultural activities in fields surrounding the yellow perch (Perca flavescens) habitat in Lake St. Pierre (Quebec, Canada), a fluvial lake of the river where the perch population has collapsed. Clothianidin and chlorantraniliprole were two of the most detected insecticides in surface waters near perch spawning areas. The objectives of the present study were to evaluate the transcriptional and biochemical effects of these two pesticides on juvenile yellow perch exposed for 28d to environmental doses of each compound alone and in a mixture under laboratory/aquaria conditions. Hepatic mRNA-sequencing revealed an effect of chlorantraniliprole alone (37 genes) and combined with clothianidin (251 genes), but no effects of clothianidin alone were observed in perch. Dysregulated genes were mostly related to circadian rhythms and to Ca2+ signaling, the latter effect has been previously associated with chlorantraniliprole mode of action in insects. Moreover, chronic exposure to clothianidin increased the activity of acetylcholinesterase in the brain of exposed fish, suggesting a potential non-target effect of this insecticide. Further analyses of three clock genes by qRT-PCR suggested that part of the observed effects of chlorantraniliprole on the circadian gene regulation of juvenile perch could be the result of time-of-day of sacrifice. These results provide insight into biological effects of insecticides in juvenile perch and highlight the importance of considering the circadian rhythm in experimental design and results analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,268
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,064 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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