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Enregistrement W4394932817 · doi:10.1038/s41467-024-47647-0

An esophagus cell atlas reveals dynamic rewiring during active eosinophilic esophagitis and remission

2024· article· en· W4394932817 sur OpenAlex
Jiarui Ding, John J. Garber, Amiko M. Uchida, Ariel Lefkovith, Grace T. Carter, Praveen Vimalathas, Lauren Canha, Michael Dougan, Kyle Staller, Joseph C. Yarze, Toni Delorey, Orit Rozenblatt–Rosen, Orr Ashenberg, Daniel B. Graham, Jacques Deguine, Aviv Regev, Ramnik J. Xavier

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEosinophilic Esophagitis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésEosinophilic esophagitisInflammationEosinophilImmunologyPathogenesisInterleukin 13Mast cellMedicineBiologyCancer researchCell biologyPathologyDiseaseAsthmaInterleukinCytokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Coordinated cell interactions within the esophagus maintain homeostasis, and disruption can lead to eosinophilic esophagitis (EoE), a chronic inflammatory disease with poorly understood pathogenesis. We profile 421,312 individual cells from the esophageal mucosa of 7 healthy and 15 EoE participants, revealing 60 cell subsets and functional alterations in cell states, compositions, and interactions that highlight previously unclear features of EoE. Active disease displays enrichment of ALOX15 + macrophages, PRDM16 + dendritic cells expressing the EoE risk gene ATP10A , and cycling mast cells, with concomitant reduction of T H 17 cells. Ligand–receptor expression uncovers eosinophil recruitment programs, increased fibroblast interactions in disease, and IL-9 + IL-4 + IL-13 + T H 2 and endothelial cells as potential mast cell interactors. Resolution of inflammation-associated signatures includes mast and CD4 + T RM cell contraction and cell type-specific downregulation of eosinophil chemoattractant, growth, and survival factors. These cellular alterations in EoE and remission advance our understanding of eosinophilic inflammation and opportunities for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,845
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle