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Enregistrement W4394950328 · doi:10.14785/lymphosign-2024-0002

Dual novel variants in CD40 leading to hyper IgM syndrome: a case report of a school-aged female with new-onset recurrent pneumonia

2024· article· en· W4394950328 sur OpenAlexaffvenue
J. Chen, Anahita Dehmoobad Sharifabadi, Jenny Garkaby

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPneumoniaMedicinePediatricsAtypical pneumoniaImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Hyper IgM (HIGM) syndrome is an inborn error of immunity (IEI) that occurs due to defects in immunoglobulin class switch recombination (Ig-CSR). HIGM syndrome typically presents with recurrent infections in early childhood, and is often characterized on investigation with decreased IgG, IgA, and IgE titres, alongside normal or elevated IgM. A common cause of HIGM syndrome is a disruption to the CD40-CD40 ligand (CD40L) interaction that triggers Ig-CSR, of which variants in CD40 are much rarer than those in CD40L. We present a case of an 11-year-old female with HIGM syndrome caused by two novel variants of in the CD40 gene. Aim: To describe a case report of an eleven-year-old female with HIGM syndrome presenting with recurrent pneumonia. Methods: Data was collected retrospectively from the patient’s medical records. Laboratory investigations included quantitative immunoglobulins, quantitative B and T cell subsets, genetic testing using a primary immunodeficiency panel, and a functional assay for CD40 expression. Results: The proband is an 11-year-old female, who presented with recurrent pneumonia, otitis, and septic arthritis. Investigations revealed neutropenia, low IgA, elevated IgM and normal IgG, along with absent vaccine responses. She was identified to harbour two novel variants in CD40: an intronic variant c.52-13A>G p.(?) and a missense variant c.466T>C p.(Ser156Pro). Functional assay indicated low expression of CD40 compared to healthy control, confirming the diagnosis of CD40 deficiency. Conclusion: Class switch defects, such as CD40 deficiency, are rare but significant diagnoses within the spectrum of IEI. This case demonstrates that despite the absence of some clinical red flags for immunodeficiency in infancy, IEIs remain an important consideration in pediatric patients regardless of age. Increasing clinical awareness of IEI will lead to earlier diagnoses, initiation of appropriate treatment, and prevention of potential complications. Statement of novelty: We describe a patient with a late presentation of hyper IgM syndrome due to two novel variants in the CD40 gene, thus expanding the spectrum of CD40 gene variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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