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Enregistrement W4394963644 · doi:10.1073/pnas.2306382121

Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons

2024· article· en· W4394963644 sur OpenAlexfundno aff
Simon Chamberland, Gariel Grant, Robert Machold, Erica R. Nebet, Guoling Tian, Joshua Stich, Monica Hanani, Klas Kullander, Richard W. Tsien

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeVetenskapsrådetNational Institute of Mental HealthFonds de recherche du QuébecFonds de Recherche du Québec - SantéNational Cancer InstituteHjärnfondenNational Institute on Drug AbuseYork UniversityCharles H. Revson FoundationNYU Langone Medical CenterBrain and Behavior Research Foundation
Mots-clésHippocampal formationSomatostatinNeuroscienceBiologyInterneuronHippocampusInhibitory postsynaptic potential

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hippocampal somatostatin-expressing ( Sst ) GABAergic interneurons (INs) exhibit considerable anatomical and functional heterogeneity. Recent single-cell transcriptome analyses have provided a comprehensive Sst -IN subpopulations census, a plausible molecular ground truth of neuronal identity whose links to specific functionality remain incomplete. Here, we designed an approach to identify and access subpopulations of Sst -INs based on transcriptomic features. Four mouse models based on single or combinatorial Cre- and Flp- expression differentiated functionally distinct subpopulations of CA1 hippocampal Sst- INs that largely tiled the morpho-functional parameter space of the Sst -INs superfamily. Notably, the Sst;;Tac1 intersection revealed a population of bistratified INs that preferentially synapsed onto fast-spiking interneurons (FS-INs) and were sufficient to interrupt their firing. In contrast, the Ndnf;;Nkx2-1 intersection identified a population of oriens lacunosum-moleculare INs that predominantly targeted CA1 pyramidal neurons, avoiding FS-INs. Overall, our results provide a framework to translate neuronal transcriptomic identity into discrete functional subtypes that capture the diverse specializations of hippocampal Sst -INs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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