Growing a Cystic Fibrosis-Relevant Polymicrobial Biofilm to Probe Community Phenotypes
Notice bibliographique
Résumé
Most in vitro models lack the capacity to fully probe bacterial phenotypes emerging from the complex interactions observed in real-life environments. This is particularly true in the context of hard-to-treat, chronic, and polymicrobial biofilm-based infections detected in the airways of individuals living with cystic fibrosis (CF), a multiorgan genetic disease. While multiple microbiome studies have defined the microbial compositions detected in the airway of people with CF (pwCF), no in vitro models thus far have fully integrated critical CF-relevant lung features. Therefore, a significant knowledge gap exists in the capacity to investigate the mechanisms driving the pathogenesis of mixed species CF lung infections. Here, we describe a recently developed four-species microbial community model, including Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Streptococcus sanguinis, and Prevotella melaninogenica grown in CF-like conditions. Through the utilization of this system, clinically relevant phenotypes such as antimicrobial recalcitrance of several pathogens were observed and explored at the molecular level. The usefulness of this in vitro model resides in its standardized workflow that can facilitate the study of interspecies interactions in the context of chronic CF lung infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».