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Enregistrement W4394989132 · doi:10.1101/2024.04.16.589699

JUND plays a genome-wide role in the quiescent to contractile switch in the pregnant human myometrium

2024· preprint· en· W4394989132 sur OpenAlexaff
Nawrah Khader, Anna Dorogin, Oksana Shynlova, Jennifer A. Mitchell

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyometriumGenomeCell biologyPregnancyBusinessObstetricsBiologyMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The myometrium, the muscular layer of the uterus, undergoes crucial transitions during pregnancy, maintaining quiescence throughout gestation, and generating coordinated contractions during labor. Dysregulation of this transition can lead to premature labor with serious complications for the infant. Despite extensive gene expression data available for varying myometrial states, the molecular mechanisms governing the increase in contraction- associated gene expression at labor onset remain unclear. Transcription factors, such as JUND and progesterone receptor (PR), play essential roles in regulating transcription of select myometrial contraction-associated genes, however, a broader understanding of their involvement in transcriptional regulation at a genome-wide scale is lacking. This study examines changes in transcription and JUND binding within human myometrial tissue during the transition from quiescence (term-not-in labor/TNIL) to contractility (term labor/TL). Total RNA- sequencing reveals a global increase in primary transcript levels at TL, with AP-1/JUND binding motifs overrepresented in the promoters of upregulated transcripts. Interestingly, ChIP-seq analysis demonstrates higher JUND enrichment in TNIL compared to TL tissues, suggesting its role in preparing the myometrium for labor onset. Integration of JUND and PR ChIP-seq data identifies over 10,000 gene promoters bound by both factors at TNIL and TL, including genes involved in labor-driving processes. Additionally, the study uncovers elevated levels of enhancer RNAs (eRNAs) at intergenic JUND peaks in laboring myometrial tissues, and implicates additional transcription factors, such as NFKB and ETS, in the regulatory switch from quiescence to contractility. In summary, this research enhances our understanding of the myometrial molecular regulatory network during pregnancy and labor, shedding light on the roles of JUND and PR in gene expression regulation genome-wide. These findings open avenues for further exploration, potentially leading to improved interventions for preventing premature labor and the associated complications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,891
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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