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Enregistrement W4395012002 · doi:10.1021/acs.jproteome.4c00254

Identification and Evaluation of Blood-Based Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm

2024· article· en· W4395012002 sur OpenAlexaff
Ben Li, Hamzah Khan, Farah Shaikh, Abdelrahman Zamzam, Rawand Abdin, Mohammad Qadura

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAortic aneurysm repair treatments
Établissements canadiensMcMaster UniversityArtificial Intelligence in Medicine (Canada)University of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesBlair Foundation
Mots-clésAbdominal aortic aneurysmMedicineBiomarkerCohortInternal medicineReceiver operating characteristicAortic aneurysmProspective cohort studyArea under the curveAneurysmOncologyCardiologyRadiologyAorta

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Blood-based biomarkers for abdominal aortic aneurysm (AAA) have been studied individually; however, we considered a panel of proteins to investigate AAA prognosis and its potential to improve predictive accuracy. MATERIALS AND METHODS: = 452), we conducted a prognostic study to develop a model that accurately predicts AAA outcomes using clinical features and circulating biomarker levels. Serum concentrations of 9 biomarkers were measured at baseline, and the cohort was followed for 2 years. The primary outcome was major adverse aortic event (MAAE; composite of rapid AAA expansion [>0.5 cm/6 months or >1 cm/12 months], AAA intervention, or AAA rupture). Using 10-fold cross-validation, we trained a random forest model to predict 2 year MAAE using (1) clinical characteristics, (2) biomarkers, and (3) clinical characteristics and biomarkers. RESULTS: Two-year MAAE occurred in 114 (25%) patients. Two proteins were significantly elevated in patients with AAA compared with those without AAA (angiopoietin-2 and aggrecan), composing the protein panel. For predicting 2 year MAAE, our random forest model achieved area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) 0.74 using clinical features alone, and the addition of the 2-protein panel improved performance to AUROC 0.86. CONCLUSIONS: Using a combination of clinical/biomarker data, we developed a model that accurately predicts 2 year MAAE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil0,285

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,110
Tête enseignante GPT0,456
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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