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Enregistrement W4395031457 · doi:10.2337/dc23-2274

Time-to-Event Genome-Wide Association Study for Incident Cardiovascular Disease in People With Type 2 Diabetes

2024· article· en· W4395031457 sur OpenAlexaff
Soo Heon Kwak, Ryan B. Hernandez-Cancela, Daniel DiCorpo, David E. Condon, Jordi Merino, Peitao Wu, Jennifer A. Brody, Jie Yao, Xiuqing Guo, Fariba Ahmadizar, Mariah Meyer, Murat Sincan, Josep M. Mercader, Sujin Lee, Jeffrey Haessler, Ha My T. Vy, Zhaotong Lin, Nicole D. Armstrong, Shaopeng Gu, Noah L. Tsao, Leslie A. Lange, N. Wang, Kerri L. Wiggins, Stella Trompet, Simin Liu, Ruth J. F. Loos, Renae Judy, Philip Schroeder, Natalie R. Hasbani, Maxime M. Bos, Alanna C. Morrison, Rebecca D. Jackson, Alex P. Reiner, JoAnn E. Manson, Ninad S. Chaudhary, Lynn K. Carmichael, Yii‐Der Ida Chen, Kent D. Taylor, Mohsen Ghanbari, Joyce B. J. van Meurs, Achilleas Pitsillides, Bruce M. Psaty, Raymond Noordam, Ron Do, Kyong Soo Park, J. Wouter Jukema, Maryam Kavousi, Adolfo Correa, Stephen S. Rich, Scott M. Damrauer, Catherine Hajek, Nam Cho, Marguerite R. Irvin, James S. Pankow, Girish N. Nadkarni, Robert Sladek, Mark O. Goodarzi, José C. Florez, Daniel I. Chasman, Susan R. Heckbert, Charles Kooperberg, Josée Dupuis, Rajeev Malhotra, Paul S. de Vries, Ching‐Ti Liu, Jerome I. Rotter, James B. Meigs

Notice bibliographique

RevueDiabetes Care · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNovo Nordisk FondenU.S. Department of Veterans AffairsNational Institute on AgingNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesAmerican Diabetes Association
Mots-clésMedicineType 2 diabetesDiabetes mellitusDiseaseGenome-wide association studyAssociation (psychology)Cardiovascular eventEvent (particle physics)MEDLINEInternal medicineGeneticsEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To identify genetic risk factors for incident cardiovascular disease (CVD) among people with type 2 diabetes (T2D). RESEARCH DESIGN AND METHODS: We conducted a multiancestry time-to-event genome-wide association study for incident CVD among people with T2D. We also tested 204 known coronary artery disease (CAD) variants for association with incident CVD. RESULTS: Among 49,230 participants with T2D, 8,956 had incident CVD events (event rate 18.2%). We identified three novel genetic loci for incident CVD: rs147138607 (near CACNA1E/ZNF648, hazard ratio [HR] 1.23, P = 3.6 × 10-9), rs77142250 (near HS3ST1, HR 1.89, P = 9.9 × 10-9), and rs335407 (near TFB1M/NOX3, HR 1.25, P = 1.5 × 10-8). Among 204 known CAD loci, 5 were associated with incident CVD in T2D (multiple comparison-adjusted P < 0.00024, 0.05/204). A standardized polygenic score of these 204 variants was associated with incident CVD with HR 1.14 (P = 1.0 × 10-16). CONCLUSIONS: The data point to novel and known genomic regions associated with incident CVD among individuals with T2D.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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