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Enregistrement W4395082769 · doi:10.12688/openreseurope.17365.1

Atlantic mackerel population structure does not support genetically distinct spawning components

2024· article· en· W4395082769 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOpen Research Europe · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIINational Oceanic and Atmospheric AdministrationMinisterio de Ciencia e InnovaciónHorizon 2020 Framework ProgrammeEusko JaurlaritzaGeneralitat de CatalunyaEuropean CommissionCentre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science
Mots-clésFisheryPopulation structureMackerelPopulationBiologyFish <Actinopterygii>DemographySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: (Linnaeus, 1758) is a commercially valuable migratory pelagic fish inhabiting the northern Atlantic Ocean and the Mediterranean Sea. Given its highly migratory behaviour for feeding and spawning, several studies have been conducted to assess differentiation among spawning components to better define management units, as well as to investigate possible adaptations to comprehend and predict recent range expansion northwards. Methods: was sequenced and annotated, as an increasing number of population genetic studies have proven the relevance of reference genomes to investigate genomic markers/regions potentially linked to differences at finer scale. Such reference genome was used to map Restriction-site-associated sequencing (RAD-seq) reads for SNP discovery and genotyping in more than 500 samples distributed along the species range. The resulting genotyping tables have been used to perform connectivity and adaptation analyses. Results: resulted in a genome of 741 Mb. Our population genetic results show that the Atlantic mackerel consist of three previously known genetically isolated units (Northwest Atlantic, Northeast Atlantic, Mediterranean), and provide no evidence for genetically distinct spawning components within the Northwest or Northeast Atlantic. Conclusions: Therefore, our findings resolved previous uncertainties by confirming the absence of genetically isolated spawning components in each side of the northern Atlantic, thus rejecting homing behaviour and the need to redefine management boundaries in this species. In addition, no further genetic signs of ongoing adaptation were detected in this species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,718
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle