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Enregistrement W4395085209 · doi:10.1016/j.jaci.2024.03.025

Antibiotics taken within the first year of life are linked to infant gut microbiome disruption and elevated atopic dermatitis risk

2024· article· en· W4395085209 sur OpenAlexafffund
Courtney Hoskinson, Maria Medeleanu, Myrtha E. Reyna, Darlene Dai, Biswajit Chowdhury, Theo J. Moraes, Piush J. Mandhane, Elinor Simons, Anita L. Kozyrskyj, Meghan B. Azad, Charisse Petersen, Padmaja Subbarao

Notice bibliographique

RevueJournal of Allergy and Clinical Immunology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDermatology and Skin Diseases
Établissements canadiensMcMaster UniversityChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of ManitobaUniversity of AlbertaUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenPublic Health OntarioUniversity of TorontoBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesSickkids Research InstituteHospital for Sick ChildrenGenome British ColumbiaProvincial Health Services AuthorityBC Children's HospitalCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésAtopic dermatitisMicrobiomeAntibioticsGut microbiomeMedicineImmunologyBiologyMicrobiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Atopic dermatitis (AD) is the most common chronic inflammatory skin disease in both pediatric and adult populations. The development of AD has been linked to antibiotic usage, which causes perturbation of the microbiome and has been associated with abnormal immune system function. However, imbalances in the gut microbiome itself associated with antibiotic usage have been inconsistently linked to AD. Objectives This study aimed to elucidate the timing and specific factors mediating the relationship between systemic (oral or intravenous) antibiotic usage and AD. Methods We used statistical modeling and differential analysis to link CHILD Cohort Study participants' history of antibiotic usage and early-life gut microbiome alterations to AD. Results Here we report that systemic antibiotics during the first year of life, as compared to later, are associated with AD risk (adjusted odds ratio [aOR] = 1.81; 95% CI: 1.28-2.57; P < .001), with an increased number of antibiotic courses corresponding to a dose response–like increased risk of AD risk (1 course: aOR: 1.67; 95% CI: 1.17-2.38; 2 or more courses: aOR: 2.16; 95% CI: 1.30-3.59). Further, we demonstrate that microbiome alterations associated with both AD and systemic antibiotic usage fully mediate the effect of antibiotic usage on the development of AD (β indirect = 0.072; P < .001). Alterations in the 1-year infant gut microbiome of participants who would later develop AD included increased Tyzzerella nexilis , increased monosaccharide utilization, and parallel decreased Bifidobacterium and Eubacterium spp, and fermentative pathways. Conclusions These findings indicate that early-life antibiotic usage, especially in the first year of life, modulates key gut microbiome components that may be used as markers to predict and possibly prevent the development of AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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