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Enregistrement W4395448254 · doi:10.1101/2024.04.24.24304501

<i>MARK2</i> variants cause autism spectrum disorder <i>via</i> the downregulation of WNT/β-catenin signaling pathway

2024· preprint· en· W4395448254 sur OpenAlexaff
Maolei Gong, Jiayi Li, Yijun Liu, Matheus Vernet Machado Bressan Wilke, Qian Li, Haoran Liu, Liang Chen, Joel A. Morales‐Rosado, Ana S.A. Cohen, Susan Hughes, Bonnie Sullivan, Valerie Waddell, Marie‐José H. van den Boogaard, Richard H. van Jaarsveld, Ellen van Binsbergen, Koen L.I. van Gassen, Tianyun Wang, Susan M. Hiatt, Michelle D. Amaral, Whitley V. Kelley, Jianbo Zhao, Weixing Feng, Chang­hong Ren, Yazhen Yu, Nicole J. Boczek, Matthew J. Ferber, Carrie A. Lahner, Sherr Elliott, Yiyan Ruan, Boris Keren, Hua Xie, Xiaoyan Wang, Bernt Popp, Christiane Zweier, Juliette Piard, Christine Coubes, Frédéric Tran Mau‐Them, Hana Safraou, A. Micheil Innes, Julie Gauthier, Jacques L. Michaud, Daniel C. Koboldt, Odent Sylvie, Marjolaine Willems, Wen‐Hann Tan, Benjamin Cogné, Claudine Rieubland, Dominique Braun, Scott McLean, Konrad Platzer, Pia Zacher, Henry Oppermann, Lucie Evenepoel, Pierre Blanc, Laïla El Khattabi, Neshatul Haque, Nikita R. Dsouza, Michael T. Zimmermann, Raúl Urrutia, Eric W. Klee, Yiping Shen, Hong‐Zhen Du, Zailong Qin, Chang‐Mei Liu, Xiaoli Chen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayNeurodevelopmental disorderAutism spectrum disorderAutismBiologyNeural stem cellInduced pluripotent stem cellMissense mutationGeneticsPhenotypeSignal transductionGeneEmbryonic stem cellMedicineStem cellPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract MARK2 , a member of the evolutionarily conserved PAR1/MARK serine/threonine kinase family, has been identified as a novel risk gene for autism spectrum disorder (ASD) based on the enrichment of de novo loss-of-function (Lof) variants in large-scale sequencing studies of ASD individuals. However, the features shared by affected individuals and the molecular mechanism of MARK2 variants during early neural development remained unclear. Here, we report 31 individuals carrying heterozygous MARK2 variants and presenting with ASD, other neurodevelopmental disorders, and typical facial dysmorphisms. Lof variants predominate (81%) in affected individuals, while computational analysis and in vitro transfection assay also point to MARK2 loss resulting from missense variants. Using patient-derived and CRISPR-engineered isogenic induced pluripotent stem cells (iPSCs), and Mark 2 +/- (HET) mice, we show that MARK2 loss leads to systemic neurodevelopmental deficits, including anomalous polarity in neural rosettes, imbalanced proliferation and differentiation in neural progenitor cells (NPCs), abnormal cortical development and ASD-like behaviors in mice. Further using RNA-Seq and lithium treatment, we link MARK2 loss to the downregulated WNT/β-catenin signaling pathway and identify lithium as a potential drug for treating MARK2 -related ASD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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