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Enregistrement W4395449227 · doi:10.1016/j.orggeochem.2024.104782

The global distribution of Isoprenoidal Glycerol Dialkyl Diethers (isoGDDs) is consistent with a predominant degradation origin

2024· article· en· W4395449227 sur OpenAlexaff
Joe S. Hingley, César C. Martins, Chloe Walker-Trivett, Jennifer Adams, Sebastian Naeher, Christoph Häggi, Sarah J. Feakins, B. David A. Naafs

Notice bibliographique

RevueOrganic Geochemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThaumarchaeotaGlycerolAbundance (ecology)ArchaeaEnvironmental chemistryBiologyEcologyChemistryPaleontologyBiochemistryBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerol dialkyl diethers (GDDs) are membrane lipids and a variation of the more commonly known glycerol dialkyl glycerol tetraethers (GDGTs). GDGTs include both archaeal and bacterial membrane lipids that are both frequently used for paleoclimate reconstruction in a range of terrestrial and aquatic environments. In contrast to GDGTs, GDDs lack one of the terminal glycerol moieties. Although both isoprenoidal (iso) and branched (br) GDDs have been found, this study focuses on isoGDDs. These lipids have been found in a few terrestrial and aquatic environments. However, the origin of isoGDDs is debated and the extent of their distribution across the surface of the Earth is poorly constrained. Based on a few single site studies, previous authors hypothesised that isoGDDs are degradation products of isoGDGTs, but more recent studies that isolated isoGDDs from cultured nitrososphaerota (formerly thaumarchaeota) proposed a biological source through direct archaeal biosynthesis. Here we compiled a global dataset of isoGDD and isoGDGT abundance in environmental samples to thoroughly investigate the distribution of isoGDDs and the correlation with isoGDGTs on a global scale and across a variety of environments (peat, mineral soils, lake sediments, and marine sediments). We find that isoGDDs are present in most samples that we analysed. Their abundance is strongly proportional to isoGDGT abundance (r2 = 0.85), dominated by the GDGT-crenarchaeol/GDD-crenarchaeol ratio (r2 = 0.94) and supported by individual compound isoGDGT/isoGDD ratios (r2 = 0.56–0.94). In addition, the degree of cyclisation of isoGDDs, reflected in the ring index, is positively correlated (r2 = 0.84) with that of isoGDGTs across all environments. We conclude that isoGDDs are abundant on the surface of the Earth and predominantly originate from the degradation of isoGDGTs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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