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Enregistrement W4395456040 · doi:10.4236/ojmm.2024.142009

Phenotypic Characterization of Extended Spectrum Beta-Lactamase, Class C Cephalosporinase and Carbapenemase-Producing <i>Klebsiella</i> Species Isolated from Patients Consulted at Four Yaounde-Based Hospitals

2024· article· en· W4395456040 sur OpenAlexfundno aff
Emilia Lyonga, Mangum Patience Kumcho, Michel Toukam, Dieudonné Sedena, Florence Anjabie Enyeji, Aime-Caesar Teukam, Modestine Djuissi, Martha Mesembe, George Mondinde Ikomey, Agnes Eyoh, Hortense Kamga Gonsu

Notice bibliographique

RevueOpen Journal of Medical Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOrganization for Women in Science for the Developing WorldInternational Development Research Centre
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeBeta-lactamasePhenotypeMedicineInternal medicineMicrobiologyCardiologyBiologyGeneticsGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Klebsiella spp. are bacteria of medical importance for their role in opportunistic infections which are often difficult to treat because of resistance to one or several antimicrobials. The aim of this study was to determine antimicrobial resistance due to Extended Spectrum Beta-lactamase (ESBL), Class C cephalosporinase (AmpC) and carbapenemase enzymes in Klebsiella spp. isolated from patients consulted at four hospitals. Methodology: The study was cross-sectional and descriptive. A total of 4190 non-repetitive patients’ specimens from 13 types of clinical specimens were analysed from February to November 2020. Two hundred and twenty-five (225) Klebsiella spp isolates were identified using API 20E and antimicrobial susceptibility testing done according to the Kirby Bauer disc diffusion method. ESBL and AmpC phenotypes were determined by the combination disc method and carbapenemases by double disc synergy method, referenced by EUCAST guidelines for the resistance testing. Results: The frequency of the species was Klebsiella pneumoniae (69%, 155/255), K. oxytoca (14%, 31/255), K. ozaenae (12%, 27/225) and K. rhinoscleromatis (5%, 11/225). Isolates were most resistant to sulphomethoxazole trimethoprim (84%, 189/225), cepaholosporins (80%, 180/225), and least resistant to carbapenems (10.7%, 24/225). Two K. oxytoca and one K. pneumoniae were resistant to all antibiotics tested. Klebsiella pneumoniae had the most multidrug resistant isolates (59.4%, 134/225). Most isolates (83.6%, 188/225) expressed at least one enzyme, while 63.6% (143/225) of the isolates expressed at least two enzymes. Some isolates were ESBL (71.6%, 161/225), carbapenemase (10.7%, 24/225) and AmpC (6.6%, 15/225) producers. Three carbapenemases (Klebsiella pneumoniae carbapenemase-KPC, Metallo-Beta Lactamase-MBL and OXA-48) were detected. Conclusion: These results revealed that resistance of Klebsiella spp. to cephalosporins is high and this may be exacerbated by co-expression of AmpC and carbapenemases aggravating associated patient morbidity and mortality. Monitoring of antimicrobial resistance of local strains is necessary for informed decisions on empirical treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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