Pathogen Surveillance in Swallows (Family Hirundinidae): Investigation into Role as Avian Influenza Vector in Eastern Canada Agricultural Landscapes
Notice bibliographique
Résumé
First detected in Atlantic Canada in December 2021, highly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) subtype H5N1 clade 2.3.4.4b, A/Goose/Guangdong/1/96 lineage, has caused massive mortality in wild birds and domestic poultry in North America. Swallows (Hirundinidae), abundant in North American agricultural ecosystems, have been proposed as possible (bridge) species for HPAIV transmission between wild and domestic birds. We aimed to seek evidence of the potential role of swallows in bridging AIV infection between wild bird reservoirs and poultry flocks in eastern Canada. During a wide-scale outbreak of HPAIV in wild birds and poultry farms across eastern Canada, 200 samples were collected from swallow breeding sites in the Canadian provinces of New Brunswick, Nova Scotia, Ontario, and Quebec, June-August 2022. Samples came from Barn Swallow (Hirundo rustica; n=142), Tree Swallow (Tachycineta bicolor; n=56), and Cliff Swallow (Petrochelidon pyrrhonota; n=2) nests. All samples tested negative for AIV, suggesting that HPAIV and low pathogenic AIV (LPAIV) strains were probably not circulating widely in swallows during the 2022 breeding season in eastern Canada; thus swallows may present a low risk of transmitting AIV. Within a management context, these findings suggest that removing nests of Barn Swallows, a species at risk in Canada, from the exterior of biosecure domestic poultry facilities may not significantly reduce risks of HPAI transmission to poultry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».