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Enregistrement W4395677717 · doi:10.1089/bio.2023.0112

An Approach to Evaluate the Costs and Outputs of Academic Biobanks

2024· article· en· W4395677717 sur OpenAlexaff
Amanda Rush, Daniel Catchpoole, Peter H. Watson, Jennifer A. Byrne

Notice bibliographique

RevueBiopreservation and Biobanking · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensGenome Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiobankValue (mathematics)SustainabilityCohortMedicineComputer scienceBioinformaticsBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Academic biobanks commonly report sustainability challenges, which may be exacerbated by a lack of information on biobank value. To better understand the costs and supported outputs that contribute to biobank value, we developed a systematic, generalizable methodology to determine biobank inputs and publications arising from biobank-supported research. We then tested this in a small cohort ( n = 12) of academic cancer biobanks in New South Wales, Australia. A proforma was developed to capture monetary and in-kind biobank costing data from biobank managers and publicly available sources. Participating biobanks were grouped and compared according to the following two classifications: open- versus restricted-access and high versus low total annual costs. Our methodology provides a feasible approach for capturing comprehensive costing data for a defined period. Characterization of biobanks using this approach showed that median total costs, as well as median staffing and in-kind costs, were comparable for open- and restricted-access biobanks, as were the quantity and journal impact metrics of supported publications. High- and low-cost biobanks supported similar median numbers of publications; however, high-cost biobanks supported publications with higher median journal impact factor and Altmetric scores. Overall, 9 of 10 biobanks had higher Field-Weighted Citation Impact scores than the global average for similar publications. This is the first tested, generalizable approach to analyze the costs and publications arising from biobank-supported research. By determining explicit cost and output data, academic biobanks, funders, and policymakers can engage in or support informed redirection of resourcing and/or benchmark setting with the aim of improving biobank support of research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,050
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,142
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,950
Score d'incertitude au seuil0,263

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0500,142
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0200,025
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,455
Tête enseignante GPT0,551
Écart entre enseignants0,096 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineÉvaluation
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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