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Enregistrement W4395677874 · doi:10.1016/j.emcon.2024.100349

Multiplex analysis platform for evaluation of endocrine disruption of emerging contaminants against human steroid hormone receptors using autobioluminescent yeast bioassay: Application to bisphenols

2024· article· en· W4395677874 sur OpenAlexafffund
Yuan Huang, Wei Zhang, Ruiguo Wang, Zhiming Xiao, John P. Giesy, Liming Wu, Xiaoou Su

Notice bibliographique

RevueEmerging contaminants · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDepartment of Environmental SciencesNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of Agricultural SciencesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramState Administration of Foreign Experts AffairsMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaBaylor UniversityChinese Academy of SciencesCanada Research Chairs
Mots-clésBioassayEndocrine systemSteroidYeastReceptorBiologyHormoneChemistryPharmacologyComputational biologyBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Emerging synthetic or derivative chemicals have drawn global concern due to their potential endocrine-disrupting effects, either as agonists or antagonists or through indirect effects on enzymes of signal transduction pathways. Currently, in vitro screening models are limited to poor tolerance, robustness, high cost and need for sphisticated equipment or complex procedures that require high levels of expertise. Herein, a multiplex analysis platform based on autobioluminescent yeast strains, including BLYhERαS, BLYhERβS, BLYhPRS, BLYhARS, BLYhMRS, and BLYhGRS, was developed for use in easy, rapid, robust, and sensitive screening for potential modulation of endocrine systems. Methods were applied to assess endocrine-disrupting effects of Bisphenol A (BPA) and its alternatives. Disrupting activities of bisphenols (BPs) varied greatly, and some BPA substitutes exerted more potent activities than those of BPA. Most BPs were primarily agonists of ERα and ERβ, while others were antagonists to AR, PR, GR, and MR. BPP and BPM exhibited non-monotonic dose-response relationships toward ERα and ERβ, and BHPF and BPG displayed converse disrupting activities to ERα and ERβ. Overall, the bioassay system provides an efficient tool for comprehensive evaluation of endocrine-disrupting activities of emerging contaminants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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