MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4396214298 · doi:10.1101/2024.04.26.591342

Advancing cooperative breeding research with a peer-reviewed and “live” Cooperative-Breeding Database (Co-BreeD)

2024· preprint· en· W4396214298 sur OpenAlexaff
Yitzchak Ben Mocha, Maike Woith, Szymon M. Drobniak, Shai Markman, Francesca Frisoni, Vittorio Baglione, Jordan Boersma, Laurence Cousseau, Rita Covas, Guilherme Henrique Braga de Miranda, Cody J. Dey, Claire Doutrelant, Roman Gula, Robert Heinsohn, Sjouke A. Kingma, Jianqiang Li, Kyle‐Mark Middleton, Andrew N. Radford, Carla Restrepo, Dustin R. Rubenstein, Carsten Schradin, Jörn Theuerkauf, Miyako H. Warrington, Dean A. Williams, Iain A. Woxvold, Michael Griesser

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Nautical Research SocietyEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreedCooperative breedingDatabaseComputer scienceWorld Wide WebBiologyAnimal scienceZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Research on cooperative breeding (a system with the core characteristic of individuals providing care for the offspring of others) is important for understanding sociality and cooperation. However, large-scale comparative analyses on the drivers and consequences of cooperation frequently use considerably inaccurate datasets (e.g. due to inconsistent definitions and outdated information). To advance comparative research on cooperative breeding, we introduce the Co operative- Bree ding D atabase (Co-BreeD), a growing database of key socio-biological parameters of birds and mammals. First, we describe Co-BreeD’s structure as a (i) sample-based (i.e. multiple samples per species linked to an exact sampling location and period), (ii) peer-reviewed and (iii) updatable resource. Respectively, these curating principles allow for (i) investigating intra- and inter-species variation and linking between fine-scale social and environmental parameters, (ii) accuracy and (iii) continuous correction and expansion with the publication of new data. Second, we present the first Co-BreeD dataset, which estimates the prevalence of breeding events with potential alloparents in 265 samples from 233 populations of 150 species, including 2 human societies (N = 26,366 breeding events). We conclude by demonstrating (i) how Co-BreeD facilitates more accurate comparative research (e.g. increased explanatory power by enabling the study of cooperative breeding as a continuous trait, and statistically accounting for the sampling error probabilities), and (ii) that cooperative breeding in birds and mammals is more prevalent than currently estimated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,141
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,141
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0170,014
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0060,007
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetGenetic and phenotypic traits in livestock→Travaux en français237 207→