Response of protein coding genes and microRNAs to temperature changes in four insect species
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Insects are the most abundant described living creatures in the world, and they play important roles in our global ecosystem. Climate change affects global biodiversity, and researchers in many fields are striving to better understand the impact of the climate crisis. One such endeavour is the study of temperature-dependent effects on insects. At present, we know little of how climate affects gene expression in insects of different sexes. Here, we took four species of fruit flies of the genus Drosophila ( D. melanogaster, D. virilis, D. pseudoobscura, and D. erecta ), and subjected the male and female flies of each species to three different temperatures to test their sex-specific gene expression responses. A total of 144 transcriptomic profiles of protein-coding genes and microRNAs were generated. We found that, at the same temperature, there were more male-biased than female-biased protein-coding genes and microRNAs in all four investigated drosophilid species. Interestingly, upon temperature changes, there were more differentially expressed protein-coding genes in females than in males in all four investigated species, while the microRNAs were highly species- and sex-specific. This study provides the first evidence that sex-biased protein-coding gene and microRNA expression responses to temperature change differ between insect species within the same genus, and demonstrates the complexity of sex-specific responses of insects to climate change. Highlights At the same temperature, protein coding gene and microRNA expression showed a greater bias towards males than towards females in all four tested insect species. In response to increasing temperature, females of all 4 tested species exhibited more differentially expressed genes than did males, and enrichment analyses showed that they are species-specific. Differentially expressed microRNAs did not show a conserved trend between insects upon temperature changes. Sex-specific gene and microRNA expression of insects in response to climate change evidently involves a complex adaptation mechanism. Graphical Abstract
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».