Abstract PO5-25-02: Microenvironment based co-culture dependence of breast cancer and immune cell interactions on functional outcomes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The tumour microenvironment (TME) includes physical forces from interstitial fluid flow and cell-cell interactions that modulate cancer development and progression through activation of multiple oncogenic pathways leading to tumor growth and metastatic spreading. We previously reported on the role of physical forces on epithelial to mesenchymal transition (EMT) and S100 gene family expression and cell to cell adhesion properties with implications to normal breast development and cancer. Signals from the tumor exit the local tumor environment through interstitial fluid transport and cell migration where they can be found in the blood stream. We developed a whole blood RNA gene expression biomarker panel coupled with proprietary software capable of identifying the presence of an active breast cancer signature at early stages of disease with clinical study results previously reported. Here we report on results from transcriptomic and function studies with cell interaction models. Cancer cells can influence immune cells through direct contact or via secreted molecules causing the immune cells to undergo functional changes. To investigate mechanisms involved in the induction of these alterations in a model system, we performed co-culture studies with human monocytic cells and breast cancer cells. Interaction of human monocytic cells with the breast cancer cells caused significant changes in both behavior and transcriptomes. Moreover, using RNAseq and pathway analysis we demonstrated that the changes induced through the exposure to the more aggressive triple negative (TNBC) phenotype were distinct from the alterations triggered upon contact with an ER+ breast cancer cell line. We also show that cancer-immune crosstalk triggers EMT as well as activation of multiple oncogenic pathways associated with cell migration and invasion, cell chemotaxis and cell-to-cell interactions. As the interplay between cancer and immune cells plays an important role in cancer progression, these findings provide important insight into key mechanisms controlling these outcomes. Citation Format: Karen Norek, Jacob Kennard, Kenneth Fuh, Robert Shepherd, Kristina Rinker, Olesya Kharenko. Microenvironment based co-culture dependence of breast cancer and immune cell interactions on functional outcomes [abstract]. In: Proceedings of the 2023 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2023 Dec 5-9; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(9 Suppl):Abstract nr PO5-25-02.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».