Abstract PO1-02-01: T Cell Receptor Sequencing to Monitor Pelareorep-Induced Expansion of Tumor Infiltrating Lymphocytes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Tumor infiltrating lymphocytes (TILs) represent a major immunological tumor control mechanism that is associated with better prognosis in breast cancer. We have previously reported the effect of pelareorep (pela), an intravenously delivered, non-engineered oncolytic reovirus, on a composite measurement of TILs and tumor cellularity (CelTIL) from the AWARE-1 window-of-opportunity study in patients with early breast cancer (eBC). These results showed treatment increased in CelTIL scores especially in the atezolizumab group. To confirm and extend these findings we applied T cell receptor sequencing of matched tumor tissue and whole blood pre and post-treatment from the AWARE-1 study to further explore the effects of pela therapy on TILs. Methods: Newly diagnosed HR+/HER2- eBC patients were enrolled into two cohorts: Cohort 1: pela + letrozole (n=10); and Cohort 2: pela + letrozole + atezolizumab (n=10). Pela was administered on days 1, 2 and 8, 9, and atezolizumab was given on day 3. Tumor biopsies (FFPE samples) collected pre-treatment (~D-23) and on day ~21 when tumors were surgically removed. T cell fraction analysis and T cell receptor sequencing were performed by Adaptive Biotechnology (Seattle, Washington) Immunoseq protocol. Results: As was shown for the CelTIL scores, an increase in the tumor T cell fraction, a direct measurement of TILs, was observed at 1-month post-treatment in both cohorts with a mean percent increase of 21% for Cohort 1 and 67% for Cohort 2. Through TCR-sequencing of tumor tissue, we identified TIL clones and tracked their differential abundance in tumor tissue and blood post-treatment. The results of this analysis at Day 21 showed a mean post-treatment expansion of 10 tumor specific clones in the blood for Cohort 1, and a mean post-treatment increase of 40 tumor specific clones for Cohort 2. Conclusions: These results confirm the previously reported CelTIL results from AWARE-1 on pela-induced increases in TILs and demonstrate the expansion of these clones in both tumor and blood as a consequence of pela therapy for HR+/HER2- breast cancer. Citation Format: Richard Trauger, Houra Loghmani, Matt Coffey, Fernando Salvador, Joaquín Gavilá, Luis Manso, Tomás Pascual, Aleix Prat, Thomas Heineman. T Cell Receptor Sequencing to Monitor Pelareorep-Induced Expansion of Tumor Infiltrating Lymphocytes [abstract]. In: Proceedings of the 2023 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2023 Dec 5-9; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(9 Suppl):Abstract nr PO1-02-01.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».