Abstract PO3-01-13: A study of the impact of the implementation of the Oncotype Dx 21-gene breast-cancer assay during the SARS-CoV-2 pandemic for 1-3 node positive early breast cancer: The Clatterbridge Cancer Centre Experience
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: The 21-gene breast cancer (BC) assay (Oncotype Dx) is used to predict chemotherapy benefit in ER+, HER-2- lymph node (LN) negative BC. The RxPONDER trial demonstrated that post-menopausal patients with ER+, HER2- BC with 1-3 LN and a recurrence score (RS) of < 25 did not benefit from adjuvant chemotherapy. In response to the SARS-CoV-2 pandemic Oncotype Dx was implemented for ER+, HER2- 1-3 LN+ BC patients in Merseyside, UK (population 2.6 million) This study sought to understand the impact of this measure on clinical practice. Methods: All patients whose tumours were assessed with Oncotype Dx assay between Mar 20 - Nov 22 were identified through the Exact Sciences portal. Menopausal status, tumour characteristics, RS and chemotherapy regimen were recorded. The impact on cancer care was estimated using the number of infusions and clinic visits specified by our institution chemotherapy protocol for node positive disease. The financial impact was calculated using the test list price, estimated costs of adjuvant chemotherapy in the UK (Annals of Oncology, Volume 32, suppl 2 S46). The number of patients predicted to receive chemotherapy pre-oncotype DX was calculated using data from the UK PONDx trial data. Results: A total of 242 patients were tested over the 32 month period. Table 1 summarises the clinico-pathological characteristics including by RS score. The median age was 58.5 and 77.3% (n=187) were post-menopausal. The median tumour size was 25mm and median LNs with macrometastasis was 1. 198 (81.9%) patients had an RS < 25. Overall 73 patients (30%) received chemotherapy of which 34 had an RS < 25. Pre-menopausal patients were more likely to receive chemotherapy with RS < 25 than post-menopausal patients, 47.9% (23/48) vs 7.3% (11/150) respectively. In the absence of Oncotype Dx testing 169 patients would have received adjuvant chemotherapy. Therefore, 96 patients avoided chemotherapy. This equates to 1,620 chemotherapy infusions and 324 clinic attendances. The estimated cost saving was ~£50K. Conclusions: This real-world study demonstrates that the use of Oncotype DX assay for ER+,HER2- 1-3 LN+ early BC spared a significant number of patients chemotherapy during the SARS-CoV-2 pandemic, so avoiding the risk of adverse effects. This also resulted in benefits to the healthcare system with a reduction in scheduled cancer care and achieved financial savings. This, therefore, demonstrates the benefit of using the Oncotype Dx assay. Table 1: Clinico-pathological information Citation Format: Alexandra Johnson, Sonia Bathla, Leena Chagla, Joanne Cliff, Allison Hall, Anita Hargreaves, Clare Hart, Zafar Malik, Chandeena Roshanlall, Raj Sripadam, Carlo Palmieri, Helen Innes. A study of the impact of the implementation of the Oncotype Dx 21-gene breast-cancer assay during the SARS-CoV-2 pandemic for 1-3 node positive early breast cancer: The Clatterbridge Cancer Centre Experience [abstract]. In: Proceedings of the 2023 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2023 Dec 5-9; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(9 Suppl):Abstract nr PO3-01-13.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».