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Enregistrement W4396597768 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs23-po1-13-04

Abstract PO1-13-04: Distinct immune signatures discriminate between patients defined as exceptional survivors of metastatic breast cancer compared to those with rapidly progressing treatment resistant breast cancers

2024· article· en· W4396597768 sur OpenAlexaff
Helen Kakkassery, Thanussuyah Alaguthurai, Zuza Kozik, Paul Buckley, Ruifang Lu, Esme Carpenter, Rosalind Graham, Gheed Alhity, Farhana Hossain, Sadiyah Mukhtar, Syed Haider, Jyoti S. Choudhary, Sheeba Irshad

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineOncologyMetastatic breast cancerImmune systemInternal medicineCancerImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: "Atypical responders" can encompass three sub- categories of patients: "exceptional responders" (those with an unusually favourable treatment response), "rapid progressors" (unusually poor or no response), and "exceptional/long-term survivors" (outlived initial prognosis). Here, we aim to investigate the drivers of immune surveillance mechanisms (local, lymphoid and peripheral) and the nature of immunological tumour recognition in exceptional survivors of stage 4 metastatic disease following standard-of-care chemo- and targeted therapies. Methods: We conducted a complementary multi-platform immune profiling study to define differences in the phenotypic immune landscape including mass-spectrometry-based proteomics on peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), multiplex cytokine profiling of patient serum, and high-dimensional flow cytometry on whole blood samples. By staining 500μl of whole blood using 2 panels, 353 immune-cell-related parameters were obtained for comparisons among the following groups: "exceptional survivors," "exceptional responders," "rapid progressors," "non-exceptional metastatic patients," "early breast cancer patients," and "healthy volunteers". Patients were matched for age, breast cancer receptor status, and sites of metastases where possible. Results: Preliminary analysis of serum biomarkers and proteome of the PBMCs of the exceptional survivors showed elevated levels of NK-cell-related proteins such as KCTD10 and RBBP7. Flow cytometry analysis revealed the presence of increased activated CD56dim NK cells, CD56bright NK cells, and central memory (CM) (CD45RA-CD27+) CD8 T cells in both the exceptional survivors and the rapid progressors. However, expression of CD25 appears to be the main mode of activation in rapid progressors compared with increased NKG2D expression in exceptional survivors. Additionally, activation of the unconventional gd T cells was evident in both groups with terminally differentiated effector memory cells re-expressing CD45RA (TEMRA) Vd1 cell predominating in the exceptional survivors. In the rapid progressors, the increased CD25+ TEMRA Vd2 cells coupled with elevated serum IL-17A and IL-1b suggest their ability to generate IL-17. Th2 cytokines, IL-5 and IL-13 were also enriched in rapid progressors and concomitant increase in CD25+ Th2 cells reveals a strong Th2-driven immune signature in these patients. Finally increased CD86+ atypical double negative (DN) B cells, mostly comprised of the DN2 subset were also significantly enriched in the rapid progressors compared to the exceptional survivors where DN1 B cells were prevalent. Conclusion: The multi-platform approach to investigating immune responses present in atypical responders has identified several distinct immunophenotypes in which the extreme outliers differ in their potential immune surveillance mechanisms. Functional validation of these findings through activation and cytotoxicity assays is currently underway and future work aims to understand the spatial biology of these circulating immune cells within the context of their primary tumours, metastases, and lymph nodes. Citation Format: Helen Kakkassery, Thanussuyah Alaguthurai, Zuza Kozik, Paul Buckley, Ruifang Lu, Esme Carpenter, Rosalind Graham, Gheed Alhity, Farhana Hossain, Sadiyah Mukhtar, Syed Haider, Jyoti Choudhary, Sheeba Irshad. Distinct immune signatures discriminate between patients defined as exceptional survivors of metastatic breast cancer compared to those with rapidly progressing treatment resistant breast cancers [abstract]. In: Proceedings of the 2023 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2023 Dec 5-9; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(9 Suppl):Abstract nr PO1-13-04.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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