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Enregistrement W4396602502 · doi:10.1101/2024.05.01.591760

PAN2-PAN3 deadenylase activity is selectively required for mitotic robustness under microtubule stress

2024· preprint· en· W4396602502 sur OpenAlexafffund
Jigyasa Verma, Zhengcheng He, Joshua A.R. Brown, P.M. Dean, Barry P. Young, Stéphane Flibotte, LeAnn J. Howe, Christopher D. Maxwell, Calvin D. Roskelley, Christopher Loewen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMitosisYeastFight-or-flight responseMicrotubuleCell biologyBudding yeastBiologyGeneticsSaccharomyces cerevisiaeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytoplasmic deadenylation by PAN2-PAN3 and CCR4-NOT regulates mRNA stability and translation, but the contribution of individual deadenylases to mitotic progression is poorly defined. Here we show that PAN2-PAN3 catalytic activity is selectively required for mitotic robustness under microtubule stress. In budding yeast, the catalytically inactive Pan2-D1020A mutant fails to complement pan2Δ nocodazole sensitivity, leading to G2/M arrest, spindle defects, and increased cell death. pan2Δ exhibits synthetic genetic interactions with tubulin and tubulin-folding genes, and RNA-seq reveals dysregulation of cell-cycle transcripts including the cyclins CLB1 and CLN3. The phenotype is stress-conditional: pan2Δ cells proliferate normally without drug. In mammalian cells, PAN2 depletion sensitizes HEK293A cells to nocodazole and colchicine and produces prolonged metaphase with multipolar spindles. Together, these findings define a conserved, stress-conditional role for PAN2-PAN3 deadenylase activity in safeguarding mitotic fidelity when microtubules are compromised.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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