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Enregistrement W4396608700 · doi:10.1016/j.bbrc.2024.150047

Lipidomic analysis of human TANGO2-deficient cells suggests a lipid imbalance as a cause of TANGO2 deficiency disease

2024· article· en· W4396608700 sur OpenAlexafffund
Mahsa Mehranfar, Paria Asadi, Rozmehr Shokohi, Miroslav P. Milev, Chiara Gamberi, Michael Sacher

Notice bibliographique

RevueBiochemical and Biophysical Research Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensMcGill UniversityConcordia University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLipid metabolismBiologyEndocrinologyInternal medicineFatty acidDiseaseVitaminBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TANGO2 deficiency disease (TDD) is a multisystem disease caused by variants in the TANGO2 gene. Symptoms include neurodevelopmental delays, seizures and potentially lethal metabolic crises and cardiac arrhythmias. While the function of TANGO2 remains elusive, vitamin B5/pantothenic acid supplementation has been shown to alleviate symptoms in a fruit fly model and has also been used with success to treat individuals suffering from TDD. Since vitamin B5 is the precursor to the lipid activator coenzyme A (CoA), we hypothesized that TANGO2-deficient cells would display changes in the lipid profile compared to control and that these changes would be rescued by vitamin B5 supplementation. In addition, the specific changes seen might point to a pathway in which TANGO2 functions. Indeed, we found profound changes in the lipid profile of human TANGO2-deficient cells as well as an increased pool of free fatty acids in both human cells devoid of TANGO2 and Drosophila harboring a previously described TANGO2 loss of function allele. All these changes were reversed upon vitamin B5 supplementation. Pathway analysis showed significant increases in triglyceride as well as in lysophospholipid levels as the top enriched pathways in the absence of TANGO2. Consistent with a defect in triglyceride metabolism, we found changes in lipid droplet numbers and sizes in the absence of TANGO2 compared to control. Our data will allow for comparison between other model systems of TDD and the homing in on critical lipid imbalances that lead to the disease state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,761

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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