Designing a smallpox B-cell and T-cell multi-epitope subunit vaccine using a comprehensive immunoinformatics approach
Notice bibliographique
Résumé
Smallpox is a highly contagious human disease caused by the variola virus. Although the disease was eliminated in 1979 due to its highly contagious nature and historical pathogenicity, with a mortality rate of up to 30%, this virus is an important candidate for biological weapons. Currently, vaccines are the critical measures to prevent this virus infection and spread. In this study, we designed a peptide vaccine using immunoinformatics tools, which have the potential to activate human immunity against variola virus infection efficiently. The design of peptides derives from vaccine-candidate proteins showing protective potential in vaccinia WR strains. Potential non-toxic and nonallergenic T-cell and B-cell binding and cytokine-inducing epitopes were then screened through a priority prediction using special linkers to connect B-cell epitopes and T-cell epitopes, and an appropriate adjuvant was added to the vaccine construction to enhance the immunogenicity of the peptide vaccine. The 3D structure display, docking, and free energy calculation analysis indicate that the binding affinity between the vaccine peptide and Toll-like receptor 3 is high, and the vaccine receptor complex is highly stable. Notably, the vaccine we designed is obtained from the protective protein of the vaccinia and combined with preventive measures to avoid side effects. This vaccine is highly likely to produce an effective and safe immune response against the variola virus infection in the body. IMPORTANCE: In this work, we designed a vaccine with a cluster of multiple T-cell/B-cell epitopes, which should be effective in inducing systematic immune responses against variola virus infection. Besides, this work also provides a reference in vaccine design for preventing monkeypox virus infection, which is currently prevalent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».