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Enregistrement W4396643009 · doi:10.1111/jnc.16120

Ependymal cells undergo astrocyte‐like reactivity in response to neuroinflammation

2024· article· en· W4396643009 sur OpenAlexafffund
Adam M.R. Groh, Nina Caporicci‐Dinucci, Elia Afanasiev, Maxime Bigotte, Brianna Lu, Joshua Gertsvolf, Matthew D. Smith, Thomas Garton, Liam Callahan‐Martin, Alexis Allot, Dale J. Hatrock, Victoria Mamane, Sienna Drake, Huilin Tai, Jun Ding, Alyson E. Fournier, Catherine Larochelle, Peter A. Calabresi, Jo Anne Stratton

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchMultiple Sclerosis Society of Canada
Mots-clésNeuroinflammationAstrocyteEpendymal CellNeuroscienceChemistryNeurogliaBiologyCentral nervous systemImmunologyInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ependymal cells form a specialized brain–cerebrospinal fluid (CSF) interface and regulate local CSF microcirculation. It is becoming increasingly recognized that ependymal cells assume a reactive state in response to aging and disease, including conditions involving hypoxia, hydrocephalus, neurodegeneration, and neuroinflammation. Yet what transcriptional signatures govern these reactive states and whether this reactivity shares any similarities with classical descriptions of glial reactivity (i.e., in astrocytes) remain largely unexplored. Using single‐cell transcriptomics, we interrogated this phenomenon by directly comparing the reactive ependymal cell transcriptome to the reactive astrocyte transcriptome using a well‐established model of autoimmune‐mediated neuroinflammation (MOG 35‐55 EAE). In doing so, we unveiled core glial reactivity‐associated genes that defined the reactive ependymal cell and astrocyte response to MOG 35‐55 EAE. Interestingly, known reactive astrocyte genes from other CNS injury/disease contexts were also up‐regulated by MOG 35‐55 EAE ependymal cells, suggesting that this state may be conserved in response to a variety of pathologies. We were also able to recapitulate features of the reactive ependymal cell state acutely using a classic neuroinflammatory cocktail (IFNγ/LPS) both in vitro and in vivo. Taken together, by comparing reactive ependymal cells and astrocytes, we identified a conserved signature underlying glial reactivity that was present in several neuroinflammatory contexts. Future work will explore the mechanisms driving ependymal reactivity and assess downstream functional consequences. image

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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