Prevalence of Antibiotic Resistance Genes (ARGs) in a small wastewater treatment plant in Egypt
Notice bibliographique
Résumé
This study aimed to evaluate the occurrence and abundance of antibiotic resistance genes (ARGs) in one of the rural wastewater treatment plants (WWTP) in Egypt, namely Hawamdya.Conventional PCR and qPCR were used to detect and quantify the abundance of β-lactam (ampC and OXA-1), sulfonamide (sul1 and sul2), tetracycline (tetO and tetW), and macrolide (ermF and ermB) as well as class 1 integron (intl1).DNA was extracted from influent, activated sludge, and effluent samples.ARGs were detected and quantified in all the tested samples using specific primers for each gene, suggesting the prevalence of ARG in the wastewater entering and persisting the WWTP.The intl1 gene, a marker for integrons, was highly abundant in the influent and activated sludge, confirming that integrons play a significant role in the spread of antibiotic resistance in the Hawamdya WWTP.The highest occurrence of sul1 and ermF genes among all samples was detected in influent, suggesting the widespread use of sulfonamide and macrolide antibiotics in the located area.The activated sludge showed comparable copy numbers for most ARGs, suggesting that it serves as a reservoir of antibioticresistance genes.The effluent showed a high copy number for sul1 and sul2 genes but a lower level of intl1, indicating that the treatment process partially removes ARGs but may be less effective against integrons.The present study revealed a high abundance of ARG, especially sulfonamide resistance genes, in tested rural WWTP as a point source of ARGs in the environment and emphasized the need to control antibiotic use and develop more effective wastewater treatment strategies to minimize the spread of antibiotic resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».