Faecal Transplantation for Ulcerative Colitis From Diet Conditioned Donors Followed by Dietary Intervention Results in Favourable Gut Microbial Profile Compared to Faecal Transplantation Alone
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: Several faecal microbial transplantation [FMT] approaches for ulcerative colitis [UC] have been investigated with conflicting results. We have recently published the clinical outcomes from the CRAFT UC Trial using FMT with the UC Exclusion Diet [UCED], compared with FMT alone. Here we aimed to compare the two FMT strategies in terms of microbial profile and function. METHODS: Subjects recruited to the CRAFT UC study with available pre- and post-intervention faecal samples were included. Donors received diet conditioning for 14 days based on the UCED principles. Group 1 received single FMT by colonoscopy [Day 1] and enemas [Days 2 and 14] without donors' dietary conditioning [N = 11]. Group 2 received FMT but with donors' dietary pre-conditioning and UCED for the patients [N = 10]. Faecal samples were assessed by DNA shotgun metagenomic sequencing. RESULTS: Following diet conditioning, donors showed depletion in metabolic pathways involved in biosynthesis of sulphur-containing amino acids. Only Group 2 showed significant shifts towards the donors' microbial composition [ADONIS: R2 = 0.15, p = 0.008] and significantly increased Eubacterium_sp_AF228LB post-intervention [β-coefficient 2.66, 95% confidence interval 2.1-3.3, q < 0.05] which was inversely correlated with faecal calprotectin [rho = -0.52, p = 0.035]. Moreover, pathways involved in gut inflammation and barrier function including branched chain amino acids were enriched post-intervention in Group 2 and were significantly inversely correlated with faecal calprotectin. CONCLUSION: FMT from diet conditioned donors followed by the UCED led to microbial alterations associated with favourable microbial profiles which correlated with decreased faecal calprotectin. Our findings support further exploration of the additive benefit of dietary intervention for both donors and patients undergoing FMT as a potential treatment of UC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».