Disturbance of the human gut microbiota in patients with Myotonic Dystrophy type 1
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Notice bibliographique
Résumé
Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is a rare autosomal dominant genetic disorder. Although DM1 is primarily characterized by progressive muscular weakness, it exhibits many multisystemic manifestations, such as cognitive deficits, cardiac conduction abnormalities, and cataracts, as well as endocrine and reproductive issues. Additionally, the gastrointestinal (GI) tract is frequently affected, encompassing the entire digestive tract. However, the underlying causes of these GI symptoms remain uncertain, whether it is biomechanical problems of the intestine, involvement of bacterial communities, or both. The primary objective of this study is to investigate the structural changes in the gut microbiome of DM1 patients. To achieve this purpose, 35 patients with DM1 were recruited from the DM-Scope registry of the neuromuscular clinic in the Saguenay-Lac-St-Jean region of the province of Québec, Canada. Stool samples from these 35 patients, including 15 paired samples with family members living with them as controls, were collected. Subsequently, these samples were sequenced by 16S MiSeq and were analyzed with DADA2 to generate taxonomic signatures. Our analysis revealed that the DM1 status correlated with changes in gut bacterial community. Notably, there were differences in the relative abundance of Bacteroidota, Euryarchaeota, Fusobacteriota, and Cyanobacteria Phyla compared to healthy controls. However, no significant shift in gut microbiome community structure was observed between DM1 phenotypes. These findings provide valuable insights into how the gut bacterial community, in conjunction with biomechanical factors, could potentially influence the gastrointestinal tract of DM1 patients.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle